177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4277 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  298  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  79.45 
 
 
150 aa  213  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  59.18 
 
 
159 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  58.65 
 
 
159 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  57.89 
 
 
159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  52.74 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  39.58 
 
 
143 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  39.42 
 
 
139 aa  101  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  37.59 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  43.88 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  37.76 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  41.67 
 
 
167 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  42.07 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  39.84 
 
 
133 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  39.86 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  38.35 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  41.38 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  44.36 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  37.96 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  37.96 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  37.96 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.83 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  40.65 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  33.85 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  38.73 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  38.73 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  37.33 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  35.66 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  39.68 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  38.71 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  38.76 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  36.52 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  38.71 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.54 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  37.98 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  38.28 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  35.38 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  41.27 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  34.97 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  36.17 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  39.06 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.83 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  35.71 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  35.66 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  36.43 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  35.04 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  32.84 
 
 
159 aa  62.8  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  32.59 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  36.3 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  35.04 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  41.96 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  41.94 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  38.76 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  35.61 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  37.27 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  32.84 
 
 
335 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  31.62 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  36.99 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  34.88 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  38.18 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  36.59 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  34.35 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  38.18 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  36.59 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  38.18 
 
 
135 aa  57.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  35.42 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  37.27 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  30.94 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  37.27 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  38.73 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  37.27 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  38.18 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  32.17 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  37.84 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  35.45 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  32.8 
 
 
170 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  37.84 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  40.57 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  36.84 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  38.46 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  35.45 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  33.91 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  41.51 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  41.51 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2583  hypothetical protein  36.26 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  32.2 
 
 
181 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  34.82 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  34.13 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  40.17 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  34.15 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  36.36 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  36.36 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  36.3 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  34.71 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  30.37 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  34.78 
 
 
134 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>