166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3315 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  84.44 
 
 
135 aa  213  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  84.44 
 
 
135 aa  213  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  81.48 
 
 
135 aa  210  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  81.48 
 
 
139 aa  208  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  81.48 
 
 
135 aa  207  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  81.48 
 
 
135 aa  205  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  80.74 
 
 
135 aa  199  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  79.26 
 
 
141 aa  199  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  76.12 
 
 
135 aa  197  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  76.12 
 
 
134 aa  191  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  70.68 
 
 
137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  67.67 
 
 
137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  65.93 
 
 
137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  66.92 
 
 
134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  66.92 
 
 
134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  69.63 
 
 
135 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  68.42 
 
 
134 aa  173  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  67.67 
 
 
134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  63.16 
 
 
135 aa  165  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  62.41 
 
 
146 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  66.17 
 
 
134 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  66.92 
 
 
134 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  64.44 
 
 
134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  68.03 
 
 
138 aa  164  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  60.9 
 
 
135 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  61.65 
 
 
135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2281  hypothetical protein  69.63 
 
 
135 aa  160  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134622  normal  0.0127263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  69.17 
 
 
138 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.170433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  65 
 
 
121 aa  157  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  63.7 
 
 
135 aa  156  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  62.3 
 
 
134 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  62.3 
 
 
134 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  63.91 
 
 
135 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  63.57 
 
 
133 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  64.66 
 
 
134 aa  146  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  63.93 
 
 
136 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  63.93 
 
 
136 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  63.93 
 
 
136 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  63.93 
 
 
136 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  63.93 
 
 
136 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  63.93 
 
 
136 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  63.93 
 
 
136 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  62.3 
 
 
136 aa  144  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  62.02 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  54.92 
 
 
133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  59.82 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  57.26 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  57.26 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  57.26 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  57.26 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  57.26 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  57.26 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  57.26 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  58.93 
 
 
132 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  54.1 
 
 
133 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  59.84 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  55.74 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  57.41 
 
 
143 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  54.37 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  45.93 
 
 
164 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  44.78 
 
 
147 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  51.85 
 
 
136 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  45.8 
 
 
158 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  45.04 
 
 
170 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  43.7 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  42.2 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  40.5 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  36.94 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  36 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  39.68 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  38.05 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  36.3 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  36.92 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  37.78 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  34.75 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  37.1 
 
 
174 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  33.63 
 
 
181 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  33.64 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  30.23 
 
 
178 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  34.4 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  38.1 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  37.6 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  43.36 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  37.59 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  43.36 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  37.98 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  37.6 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  35.25 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  34.15 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  36 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  35.94 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  34.31 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  36.3 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  36.3 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  57  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  42.48 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>