111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3621 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  95.89 
 
 		 146 aa  269  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  95.21 
 
 		 146 aa  268  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  94.52 
 
 		 146 aa  268  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  76.03 
 
 		 146 aa  213  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  69.93 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  62.24 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  61.54 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  53.15 
 
 		 143 aa  143  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  51.05 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  57.55 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  50.35 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  55.56 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  55.56 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  54.86 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  55.24 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  55.24 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  55.32 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  51.77 
 
 		 142 aa  133  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  53.47 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  51.05 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  51.75 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  47.45 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  50.69 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  45.65 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  46.15 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  52.08 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  49.29 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  50.71 
 
 		 153 aa  106  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  48.8 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  44.86 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  41.3 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  36.43 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  44.21 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  36.89 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  39.64 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  29.37 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  39.5 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  36.07 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  34.96 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  35.25 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  35.25 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  35.25 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  35.25 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  29.84 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  38.53 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  33.9 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  35.24 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  36.7 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.71 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  32.65 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  36.28 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  35.56 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  32.84 
 
 		 174 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  32.09 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  31.53 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  32.03 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  36.97 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  26.92 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  27.61 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  26.92 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  36.84 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  26.92 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  36.8 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  35.71 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  29.63 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  34.34 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  25.68 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  30.43 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  24.11 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  37.61 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  35.58 
 
 		 132 aa  42  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  31.85 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  33.93 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  33.06 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  27.41 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  34.38 
 
 		 137 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  31.82 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  28.99 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  45.1 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  31.13 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  31.9 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  32.54 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  38.1 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  38.1 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  38.1 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  38.1 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  38.1 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>