202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6184 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  100 
 
 
133 aa  260  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  48.76 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  41.67 
 
 
147 aa  93.2  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  41.79 
 
 
139 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  40 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  42.75 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  40.6 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  41.22 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  45.67 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  40.16 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  40.46 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  40.46 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  42.15 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  40.31 
 
 
144 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  35.38 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  41.44 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  37.12 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.33 
 
 
333 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  38.93 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.36 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  43.64 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  34.88 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  43.27 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  36.64 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  43.12 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  42 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  40.83 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  41.28 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  39.53 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  35.38 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  38.98 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  48.06 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  38.35 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  47.69 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  38.05 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  36.43 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  32.79 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  39.06 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  38.64 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  38.64 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  38.64 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  44.95 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  44.95 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  44.95 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  42.64 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  38.89 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  42.64 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  42.64 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  42.64 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  42.64 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  42.64 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  42.24 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  36.59 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  37.12 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  34.62 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  36.64 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  35.71 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  39.53 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  36.62 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  46.6 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  43.93 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  32.61 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  39.53 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.82 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  41.54 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  36.51 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  36.51 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  34.59 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  36.09 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1374  hypothetical protein  32.99 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  43.04 
 
 
335 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  37.89 
 
 
336 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  31.71 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  37.89 
 
 
336 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  37.25 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  37.89 
 
 
336 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  43.56 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  36.96 
 
 
336 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  37.8 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  37.89 
 
 
336 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  43.68 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  37.25 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  43.69 
 
 
132 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  43.69 
 
 
132 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  38.64 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  39.58 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  38.1 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  34.58 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  34.75 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  38.05 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  35.29 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  31.39 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  32 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  37.3 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  33.61 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  40.2 
 
 
178 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>