189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2442 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 135 aa  265  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  53.49 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  52.71 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  55.97 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  55.47 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  55.38 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  55.65 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  53.08 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  53.08 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  51.56 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  49.23 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  51.72 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  51.72 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  51.72 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  51.72 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  51.72 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  51.72 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  48.76 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  51.72 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  54.62 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  52.34 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  53.08 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  51.56 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  50.75 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  53.85 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  52.31 
 
 		 135 aa  114  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  48.76 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  53.85 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  46.92 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  50.39 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  46.15 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  53.08 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  55.77 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  52.31 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  54.81 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  50.77 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  45.24 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  47.93 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  47.93 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  46.15 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  51.54 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  57.45 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  45.67 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  42.59 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  49.23 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  46.09 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  51.13 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  47.93 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  47.93 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  47.93 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  47.93 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  47.93 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  47.93 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  47.93 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  40.77 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  45.45 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  45.38 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  51.24 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  39.67 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  49.62 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  38.89 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  43.31 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  46.46 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  39.71 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  47.58 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2281  hypothetical protein  50.77 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134622  normal  0.0127263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  45.86 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  42.62 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  38.98 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  38.4 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  36.23 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  38.4 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  41.9 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  35 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  37.9 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  37.17 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  35.77 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  35.38 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  37.72 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  37.7 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  37.7 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  35.29 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  32.59 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  32.59 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  32.58 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  37.8 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  33.83 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  35.29 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  37.88 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  35.56 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  38.17 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  36.51 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  39.62 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  33.64 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  39.62 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  39.62 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>