167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1678 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  100 
 
 		 145 aa  289  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  48.44 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  49.59 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  59.63 
 
 		 149 aa  100  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  44.53 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  43.33 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  45.3 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  42.22 
 
 		 163 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  55.96 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  45.45 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  56.88 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  56.88 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  48.62 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  48.67 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  54.13 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  36.03 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  48.48 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  51.19 
 
 		 143 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  37.67 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  46.81 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  46.39 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  40.32 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  32.12 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  35.56 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  42.48 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  33.07 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  30.66 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  39.02 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  34.62 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  39.02 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  38.58 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  36.19 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  43.62 
 
 		 168 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  40.62 
 
 		 168 aa  66.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.59 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  35.2 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  36.67 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  33.94 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  39.64 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  29.1 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  41.12 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  40.17 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  34.95 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  33.61 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  38.89 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  36.81 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  38.55 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  35.96 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  36.79 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  37.82 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  36.69 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  39.85 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  35.88 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  36.7 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  36.09 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  40.22 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  34.68 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  40.59 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  37.61 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  35.79 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.5 
 
 		 333 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  34.21 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  35.43 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  45.87 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  32.35 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  39.81 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  31.93 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  37.38 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  38.94 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  35.11 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1930  protein of unknown function DUF336  35.71 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  36.08 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  30.7 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  41.88 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  35.05 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  40.18 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  33.33 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  34.21 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  33.01 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  32.58 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  32.48 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  35.64 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  26.12 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  34.51 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  40.59 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  40.59 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  40.59 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  35.23 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  34.41 
 
 		 189 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  29.17 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  35.19 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  31.03 
 
 		 163 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.26 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  28.57 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  34.31 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  34.31 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  34.51 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  33.33 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>