189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3558 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  100 
 
 		 135 aa  266  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  91.85 
 
 		 135 aa  249  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  77.27 
 
 		 146 aa  207  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  75.42 
 
 		 121 aa  184  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  71.07 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  68.97 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  68.97 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  68.97 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  68.97 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  68.97 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  68.97 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  68.97 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  67.77 
 
 		 132 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  66.94 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  64.34 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  64.34 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  69.42 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  69.42 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  72.73 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  64.18 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  64.18 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  63.64 
 
 		 133 aa  163  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  60.45 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  64.44 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  63.57 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  59.7 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  58.96 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  59.4 
 
 		 135 aa  157  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  64.34 
 
 		 134 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  60.9 
 
 		 135 aa  155  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  66.12 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  60.9 
 
 		 139 aa  153  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  60.15 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  60.15 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  64.06 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  67.91 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  63.16 
 
 		 133 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  58.65 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  65.41 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  60.15 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  60.15 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  60.15 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  56.2 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  57.89 
 
 		 135 aa  143  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  54.89 
 
 		 135 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  57.14 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  52.63 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2281  hypothetical protein  60.15 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134622  normal  0.0127263 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  59.23 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  55.22 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170433 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  53.72 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  53.72 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  53.72 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  53.72 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  53.72 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  53.72 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  53.72 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  52.07 
 
 		 136 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  57.27 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  58.82 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  53 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  45.45 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  40.15 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  42.54 
 
 		 164 aa  98.6  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  44.07 
 
 		 170 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  42.86 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  38.46 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  37.96 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  37.61 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  41.05 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  35.16 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  40.78 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  44.74 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  38.74 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  33.58 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  39.34 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  39.06 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  34.86 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  37.27 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  36.84 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  37.82 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  34.29 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  35.61 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  41.9 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  38.33 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  34.85 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  42.34 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  40.38 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  35.66 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  40.38 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  36.88 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  37.31 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  39.25 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  36.15 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  37.27 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  36.97 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  36.94 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>