174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2446 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  69.09 
 
 		 121 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  33.14 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  38.76 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  35.29 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  38.14 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  38.6 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  37.76 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  34.07 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  34.07 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  39.05 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  34.07 
 
 		 144 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  32.58 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.09 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  35.21 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  38.68 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  35.38 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  37.37 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  37.4 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  32.37 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  37.37 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  37.38 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  37.37 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  37.37 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  37.37 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  37.37 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  37.37 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  34.13 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  30.6 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  37 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  31.61 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  39.25 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  34.59 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  35.61 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  32.71 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  32.71 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  32.71 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  35.38 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  33.63 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  31.62 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  37.82 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  34.17 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  36.61 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  34.06 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  33.57 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  32.58 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  29.71 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  38.05 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  31.01 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  36.3 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  31.13 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  34.29 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  34.26 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  33.59 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  32.73 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  31.85 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  28.99 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  36.61 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  34.55 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  28.78 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  36.03 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  29.85 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  34.59 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  34.59 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  31.86 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  27.64 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  31.86 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  32.09 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  33.04 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  33.08 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  34.21 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  28.79 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  32.59 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  31.62 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  29.41 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  36.13 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  30.43 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  33.04 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  34.21 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  33.04 
 
 		 134 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  31.58 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  38 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  30.51 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  30.51 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  30.51 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  30.51 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  31.93 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  37.1 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  30.51 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  30.51 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  30.51 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  32.17 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>