185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1583 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  98.48 
 
 
132 aa  257  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  65.38 
 
 
132 aa  173  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  50.41 
 
 
133 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  46.21 
 
 
137 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  41.27 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  41.09 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  41.86 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  38.1 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  47.37 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  37.8 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  37.8 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  48.48 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  45.86 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  45.86 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  45.86 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  45.86 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  45.86 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  45.86 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  37.01 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  41.41 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  42.5 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  39.39 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  42.45 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  37.93 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  39.37 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  34.15 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  44 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  37.69 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  44 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  35.16 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  44 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  44.44 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  35.34 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  41.41 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  41.41 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  39.53 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  38.58 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  37.69 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  36.15 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  32.03 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  41.04 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  37.72 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  34.38 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  35.38 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  39.84 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  38.76 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  42.19 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  38.89 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  36.84 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  42.19 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  42.19 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  44.55 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  37.4 
 
 
175 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  42.31 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  36.43 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  42.19 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  40.62 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  38.52 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  34.09 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  37.4 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  35.66 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  36.3 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  41.51 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  36.61 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  35.48 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  32.59 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  33.33 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  33.86 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  31.34 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  33.59 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  28.79 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  37.84 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  33.59 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  31.71 
 
 
178 aa  60.1  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  33.02 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  41.67 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  36.22 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  34.43 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  34.43 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  41.67 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  41.67 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  41.67 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  41.67 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  41.67 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  41.67 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  37.12 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  37.12 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  37.19 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  32.58 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  36.94 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  35.77 
 
 
333 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  33.56 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  38.1 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  31.62 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  31.06 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  40.62 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>