135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6971 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  273  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  63.64 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  60.14 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  60.14 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  58.74 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  57.25 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  61.31 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  62.24 
 
 		 144 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  58.45 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  58.45 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  57.14 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  57.14 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  54.68 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  57.55 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  57.25 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  57.6 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  53.96 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  57.6 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  63.7 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  55.8 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  55.07 
 
 		 146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  60.84 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  56.12 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  52.9 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  51.41 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  57.6 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  58.04 
 
 		 114 aa  130  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  48.55 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  49.28 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  51.56 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  48.57 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  43.88 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  42.25 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  38.24 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  35.61 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  35.61 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  34.85 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  39.86 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  42.4 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  30.88 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  36.04 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  34.88 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  38.53 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  35.43 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  34.82 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  35.45 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  37.19 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  32.14 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  36.3 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  39.25 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  39.25 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  33.61 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  37.1 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  38.69 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  34.15 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  25 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  33.86 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.58 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  29.2 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  35.04 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  35.04 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  28.03 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  32.08 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  32.35 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  33.07 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  39.69 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  34.71 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  36.21 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  35.54 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  35.54 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  36.97 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  32.04 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  35.07 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  34.62 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  32.76 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  35.54 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  35.2 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  31.01 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  37.31 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  33.09 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  36.52 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  36.27 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  36.27 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  36.27 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  36.27 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  36.27 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  36.27 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  36.27 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  27.34 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  37.17 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.34 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  35.54 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  37.84 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>