220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2769 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  264  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  57.89 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  77.67 
 
 
132 aa  169  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  65.38 
 
 
132 aa  160  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  62.86 
 
 
140 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  52.71 
 
 
139 aa  139  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  48.12 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  48.48 
 
 
134 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  51.54 
 
 
144 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  52.31 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  50.77 
 
 
144 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  50.77 
 
 
144 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  49.59 
 
 
135 aa  113  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  45.6 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  46.34 
 
 
133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  51.72 
 
 
144 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  46.15 
 
 
144 aa  103  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  53.57 
 
 
144 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  52.73 
 
 
144 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  39.55 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  41.41 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  46.3 
 
 
181 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  38.89 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  45.08 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  40.46 
 
 
133 aa  89.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3443  hypothetical protein  38.62 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  41.22 
 
 
137 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.02 
 
 
333 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  37.3 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  42.86 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  37.88 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.27 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  43.18 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  38.93 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.48 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  34.85 
 
 
132 aa  76.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  35.66 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  41.44 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  38.26 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  39.37 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  46.46 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  46.46 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  46.46 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.25 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  37.82 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  38.76 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  36.07 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  37.4 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  36.72 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  36.96 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  36.3 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  43.33 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  38.97 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  40.82 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  34.09 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  33.05 
 
 
170 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  35.09 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  35.66 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1324  hypothetical protein  37.31 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  39.81 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  38.52 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  36.54 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.27 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  31.25 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  35.71 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  35.56 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  35.56 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  37.14 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  37.3 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  31.75 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  35.25 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3764  hypothetical protein  38.89 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  38.89 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  38.89 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  31.82 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  36.27 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  35.82 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  31.06 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  39.13 
 
 
166 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  36.61 
 
 
132 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  34.62 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  34.13 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  34.13 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  31.11 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  33.91 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  32.31 
 
 
336 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  32.31 
 
 
336 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  30.23 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  31.2 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  32.31 
 
 
336 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.616244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>