55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2884 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  280  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  83.45 
 
 
145 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  81.38 
 
 
157 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  81.38 
 
 
145 aa  231  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  76.55 
 
 
144 aa  206  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  79.31 
 
 
144 aa  194  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  66.67 
 
 
142 aa  179  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  65.28 
 
 
142 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  65.49 
 
 
153 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  63.64 
 
 
143 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  63.89 
 
 
143 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  55.56 
 
 
143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  49.66 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  53.47 
 
 
146 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  53.9 
 
 
146 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  53.9 
 
 
146 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  53.47 
 
 
146 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  53.1 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  50.69 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  50.69 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  48.61 
 
 
152 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  53.52 
 
 
143 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  52.38 
 
 
143 aa  120  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  52.38 
 
 
143 aa  120  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  47.92 
 
 
146 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  45.71 
 
 
141 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  47.89 
 
 
142 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  43.17 
 
 
141 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  44.96 
 
 
142 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  48.2 
 
 
140 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  53.15 
 
 
114 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  46.03 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  41.84 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  34.06 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  34.45 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  35 
 
 
167 aa  52.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  29.2 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  32.35 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  29.2 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  28.47 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  30.43 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  32.5 
 
 
138 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.84 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  31.53 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  33.04 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  27.69 
 
 
165 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  30.95 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  31.78 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  31.11 
 
 
147 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  35.04 
 
 
164 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  41.11 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  25.9 
 
 
174 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  32.46 
 
 
136 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>