178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1208 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  275  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  61.07 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  49.6 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  43.7 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  45.19 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  45.19 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  48.51 
 
 		 181 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  42.22 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  42.42 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  42.75 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  47.75 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  44.35 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  40.8 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  42.86 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  46.02 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  43.75 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  46.09 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  38.64 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  46.97 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  41.74 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  40.46 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  42.86 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  39.67 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  40.83 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  44.33 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  40.15 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  40.15 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  40.15 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  44.33 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  44.33 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  44.33 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  44.33 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  44.33 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  44.33 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  42.57 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  46.21 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  46.21 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  39.53 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  38.97 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  35.66 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.94 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  35.34 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  39.39 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  44.34 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  31.62 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.64 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.37 
 
 		 333 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  40.83 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  37.25 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  38.46 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  38.17 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  35.34 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  46.08 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  38.32 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  30.6 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  39.53 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  39.34 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  39.34 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  36.15 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  34.17 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  35.04 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  34.62 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  38.33 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  36.27 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  37.4 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  41.96 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  41.96 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  35.85 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  36.43 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  41.51 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  35.43 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  36.84 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  35.94 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  38.24 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  35.07 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  35.94 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  37.72 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  37.01 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  41.51 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  35.51 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  38.39 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  38.39 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  31.65 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  37.96 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.1 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  42.24 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  38.39 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  39.05 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.71 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  35.04 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  34.59 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  32.06 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  34.06 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  32.03 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  36.59 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  39.09 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>