56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0298 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  296  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  67.13 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  65.73 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  65.73 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  65.49 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  57.86 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  62.24 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  61.31 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  60.56 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  59.56 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  55.63 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  61.54 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  55.74 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  55.74 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  52.11 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  55.15 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  52.11 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  52.11 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  53.33 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  46.53 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  50.7 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  47.41 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  50.71 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  50.71 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  48.57 
 
 		 146 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  49.28 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  43.7 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  47.97 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  43.48 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  44.8 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.29 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  32.09 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  32.09 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  32.33 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  31.34 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  32.62 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  30.88 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  34.91 
 
 		 181 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  33.64 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  33.03 
 
 		 133 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  26.72 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  30.3 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  30.91 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  34.33 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  34.27 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  35.11 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  28.7 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  33.02 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  32 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  35.61 
 
 		 132 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  28.99 
 
 		 143 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  30.88 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>