127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3828 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  278  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  98.6 
 
 
143 aa  276  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  71.33 
 
 
144 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  63.64 
 
 
146 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  64.34 
 
 
146 aa  186  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  62.94 
 
 
146 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  62.94 
 
 
146 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  61.54 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  51.75 
 
 
144 aa  150  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  57.14 
 
 
143 aa  147  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  51.05 
 
 
143 aa  140  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  52.14 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  53.15 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  52.45 
 
 
143 aa  131  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  46.15 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  51.75 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  51.75 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  53.12 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  50.69 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  48.53 
 
 
142 aa  123  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  50 
 
 
145 aa  123  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  50.35 
 
 
143 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  47.1 
 
 
141 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  47.22 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  47.22 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  52.11 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  49.21 
 
 
154 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  49.64 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  48.92 
 
 
144 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  44.04 
 
 
114 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  48.61 
 
 
144 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  42.55 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  40.58 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  40.18 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  41.79 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  43.36 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  45.54 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  42.48 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  30.43 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  33.82 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  33.82 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  42.55 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  43.24 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  38.83 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  41.59 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  33.09 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  41.59 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  43.36 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  30.95 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  33.08 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  32.8 
 
 
165 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  41.59 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  41.59 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  41.59 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  35.19 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.08 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  38.98 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  35.16 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  36 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  35.16 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  33.06 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  31.97 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  45.83 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1930  protein of unknown function DUF336  33.61 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  39.64 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  35.71 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  35.92 
 
 
167 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  33.05 
 
 
144 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  40.35 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  36 
 
 
181 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.23 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  33.64 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  26.98 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  39.42 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  35.71 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  39.42 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  30.22 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  29.85 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  39.42 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  39.42 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  39.42 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  39.42 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  39.42 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  36.36 
 
 
207 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  37.04 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  28.89 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  33.08 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  32.76 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  35.96 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  30.08 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  39.82 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  36.84 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  33.04 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  32 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  35.64 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  35.64 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  36.36 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  39 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  38.6 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  37.86 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>