191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2276 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  52.9 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  59.48 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  65.77 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  65.77 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  63.48 
 
 		 141 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  59.26 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  55.36 
 
 		 142 aa  121  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  48.85 
 
 		 147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  62.16 
 
 		 149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  62.75 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  55.75 
 
 		 149 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  39.86 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  42.06 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  38.93 
 
 		 139 aa  87.4  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.62 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  39.72 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  50.46 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  37.31 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  47.92 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  39.5 
 
 		 135 aa  72  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  40.15 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  40.91 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  40.91 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  43.07 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.77 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  36.13 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  42.98 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  39.39 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  37.98 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  41.3 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  41.44 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  39.29 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  40.44 
 
 		 133 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  36.42 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  37.21 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  40.4 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  46.36 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  46.36 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  40.14 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  40 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  40.58 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  39.2 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  30.92 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  39.83 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  37.12 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  34.09 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  41.75 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  34.81 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  42.59 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  39.34 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  41.51 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  42.59 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  36.3 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  41.48 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  35.97 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  39.52 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  39.52 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  37.98 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  43.56 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  35.25 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  40.2 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  43.56 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  43.56 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  37.12 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  39.29 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  40.37 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  40.54 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  39.62 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  40.37 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  36.43 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  40.74 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  40.57 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  40.52 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  41.67 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  33.56 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  39.09 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  40.37 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  39.45 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  35.51 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  39.81 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  39.81 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  39.64 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  33.96 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  42.22 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  42.22 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  39.45 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  42.22 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  42.22 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  42.22 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  42.22 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  42.22 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  30.56 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2583  hypothetical protein  42.2 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  37.86 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.5 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>