52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2446 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  316  9e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  54.09 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  53.09 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  54.55 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  41.88 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  42.18 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  41.84 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  41.98 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  39.62 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  38.26 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  36.71 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  41.13 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  31.51 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  36.2 
 
 		 181 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  39.1 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  40.24 
 
 		 171 aa  84  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  40.54 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  32.86 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  36.17 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  41.94 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  36.03 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  39.33 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  35.54 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  32.85 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  34.55 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  36.36 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  32.8 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  37.32 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  30.23 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  34.13 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  31.01 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  36.97 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  31.93 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  33.61 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  32.04 
 
 		 207 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.55 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  31.41 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  29.71 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  34.55 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  29.46 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  34.51 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  33.94 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  45.83 
 
 		 125 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  31.01 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  49.18 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  30.25 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  33.85 
 
 		 183 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  29.77 
 
 		 149 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  26.62 
 
 		 143 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  32.31 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>