78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0280 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  327  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  60 
 
 		 167 aa  189  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  53.09 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  58.87 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  41.01 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  36.43 
 
 		 166 aa  94  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  41.3 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  36.17 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  42.11 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  37.66 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  35.46 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  37.18 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  35.25 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  34.29 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  34.81 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  36.17 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  32.47 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  35.95 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  31.97 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  37.76 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  32.79 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  41.13 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  37.13 
 
 		 196 aa  67.4  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  34.65 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  29.27 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  40.28 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  29.71 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  28.8 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  36.23 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  31.03 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  31.48 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  34.4 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  30.7 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  31.78 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  40.43 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  35.11 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  29.32 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  33.94 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  33.94 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  33.94 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  33.94 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  33.94 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  33.94 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  33.94 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  30.56 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  38.3 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  33.58 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  35.96 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  48.39 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  34.13 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  34.13 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  37.23 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  30.7 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  30.36 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  43.9  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  30.83 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  29.71 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  35.11 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  33.68 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  30.25 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  29.85 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  29.1 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  32.14 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  35.58 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  30.95 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  33.01 
 
 		 137 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  32.35 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  28.57 
 
 		 132 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  32.79 
 
 		 165 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  28.99 
 
 		 143 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  30.1 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  35.16 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  24.64 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>