81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0150 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  335  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  76.36 
 
 		 196 aa  204  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  77.86 
 
 		 163 aa  198  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  81.29 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  61.25 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  42.86 
 
 		 165 aa  111  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  40.71 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  42.36 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  42.65 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  41.43 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  35.04 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  41.1 
 
 		 163 aa  94  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  38.75 
 
 		 169 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  37.69 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  40.8 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  43.12 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  35.4 
 
 		 163 aa  87.4  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  33.99 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  37.11 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  36.44 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  37.6 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  35.37 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  35.47 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  45.63 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  34.27 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  32.85 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  48.45 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  35.62 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  37.84 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  44.44 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  35.56 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  35.58 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  36.57 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  32.35 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  38.17 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  36.13 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  37.04 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  31.78 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  37.04 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  32.99 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  31.71 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  33.93 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  33.85 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  33.91 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  34.71 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  31.5 
 
 		 143 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  34.32 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  31.53 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  33.62 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  32.89 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  26.95 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  32.8 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  30.61 
 
 		 143 aa  47.8  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  30.77 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  39.02 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  26.81 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  34.29 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  33.06 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  32.22 
 
 		 135 aa  44.3  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  38.39 
 
 		 135 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  32.99 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  32.59 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  29.03 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  34.78 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  36.26 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  34.44 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  31.01 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  30 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  29.41 
 
 		 133 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  30.4 
 
 		 139 aa  41.2  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>