76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0926 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  335  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  65.03 
 
 
207 aa  194  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  58.51 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  50.38 
 
 
197 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  41.01 
 
 
157 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  45.95 
 
 
165 aa  97.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  45.11 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  38.6 
 
 
168 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  41.84 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  41.78 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  35.37 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  38.93 
 
 
171 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  42.18 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  40.3 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  37.4 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  36.73 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  35.88 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  42.15 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  37.35 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  37.93 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  38.36 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  34.44 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  32.85 
 
 
168 aa  72  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  45.13 
 
 
172 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  36.28 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  35.11 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  34.57 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  41.73 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  37.5 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  38.85 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  36.31 
 
 
170 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  31.16 
 
 
166 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  39.13 
 
 
168 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  42.24 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  31.54 
 
 
163 aa  58.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  39.84 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  42.72 
 
 
125 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  45.69 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  37.78 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  32.33 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  28.22 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  35.16 
 
 
160 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  38.05 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  32.82 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  32.85 
 
 
147 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  38.18 
 
 
145 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  33.94 
 
 
121 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  32.5 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  39.29 
 
 
149 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  35.96 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  33.07 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  32.74 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  37.61 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  33.66 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  28.91 
 
 
139 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  32.31 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  41.44 
 
 
166 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  31.75 
 
 
135 aa  44.7  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  31.86 
 
 
167 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0533  hypothetical protein  35.16 
 
 
122 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.773932 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 
150 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 
150 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  35.65 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  32.31 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  27.73 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  33 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  32.31 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  32.82 
 
 
136 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  29.63 
 
 
132 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  29.73 
 
 
143 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  32.59 
 
 
147 aa  41.6  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  31.54 
 
 
137 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  32.03 
 
 
134 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  32.03 
 
 
134 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  37.59 
 
 
167 aa  41.2  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>