98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2792 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 167 aa  327  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  78.42 
 
 		 163 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  81.29 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  72.5 
 
 		 196 aa  188  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  63.06 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  40.88 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  39.29 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  34.56 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  41.03 
 
 		 165 aa  97.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  36.63 
 
 		 167 aa  97.4  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  36.48 
 
 		 168 aa  94.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  37.41 
 
 		 168 aa  91.3  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  38.02 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  36.75 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  37.09 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  36.53 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  35.54 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  36.26 
 
 		 207 aa  88.2  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  36.08 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  48.44 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  34.16 
 
 		 160 aa  87.8  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  37.31 
 
 		 167 aa  87.4  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  34.1 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  35.44 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  38.12 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  34.03 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  35.85 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  34.97 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  42.65 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  38.17 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  36.92 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  32.86 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  31.43 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  37.29 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  36.54 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  34.97 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  32.84 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  35.19 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  35.11 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  37.59 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  34.86 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  30.65 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  28.19 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  35.9 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  33.06 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  33.03 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  32.79 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  30 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  31.75 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  32.5 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  32.5 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  32.5 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  34.44 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  32.5 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  32.5 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  32.5 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  32.5 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  31.85 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  36.99 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  34.59 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  31.85 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  34.78 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  35.9 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  31.85 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  31.97 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  35.14 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  33.83 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  32.59 
 
 		 134 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  29.75 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  30.89 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  32.71 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  34.44 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  31.79 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  31.34 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  29.91 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  30.37 
 
 		 134 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  30.37 
 
 		 134 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  28.48 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  30.08 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  32.33 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  31.62 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  29.91 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  30.91 
 
 		 139 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  32.26 
 
 		 132 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  32.43 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  32.43 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  31.58 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  30.7 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  29.37 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  32.33 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  27.21 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  35.11 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  31.97 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  32.33 
 
 		 135 aa  40.8  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>