219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0124 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  289  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  94.41 
 
 
143 aa  254  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  39.57 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  39.39 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  36.84 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  43.1 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  38.28 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  37.69 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  46.43 
 
 
149 aa  84.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  42.06 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  36.03 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  40.29 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  34.81 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  41.23 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.41 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  45.05 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  48.21 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  46.43 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  46.43 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  35 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  41.67 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  36.36 
 
 
133 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  35.54 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  35.48 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  33.58 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  34.35 
 
 
167 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  35.94 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  33.09 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  32.77 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  33.88 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  35.29 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  38.14 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  33.09 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  35.9 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  40 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  45.88 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  35.09 
 
 
178 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  32.06 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  32.32 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  38.21 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  38.32 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  36.97 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  35.54 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  31.71 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  39.22 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  32.35 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  39.17 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  32.82 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  37.39 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  38.24 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  37.84 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  35.83 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  32.56 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  33.08 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  31.39 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  32.62 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  38.18 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  30.66 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  35.11 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  34.58 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  31.62 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  33.81 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  33.64 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  37.23 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  37.23 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  37.23 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  28.12 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  31.58 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  31.58 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  34.4 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  35.85 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  35.83 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  30.3 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  34.38 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  34.62 
 
 
197 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  30.95 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  32.46 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  33.9 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  34.02 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  34.53 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  32.77 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  32.37 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  32.14 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  30.88 
 
 
143 aa  53.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  44.44 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  26.98 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  35.58 
 
 
166 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  34.31 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  32.62 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  25.55 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  32.26 
 
 
143 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  36.78 
 
 
189 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  36.45 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2583  hypothetical protein  36.9 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  31.25 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  34.04 
 
 
181 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>