118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0840 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  328  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  66.17 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  60.28 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  67.67 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  67.67 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  50.68 
 
 		 178 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  60.71 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  50.3 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  44.52 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  41.25 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  39.76 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  35.22 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  34.48 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  35.37 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  40.32 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  37.31 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  36.05 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  31.95 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  40.91 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  42.86 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  29.37 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  32.61 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  33.96 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  47.92 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  34.32 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  36.07 
 
 		 180 aa  70.5  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  39.01 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  38.81 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  27.54 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  39.5 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  39.29 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  32.5 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  31.01 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  34.13 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  35.11 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  35.38 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  33.64 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  40.71 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  35.82 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  35.82 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  35.82 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  35.82 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  37.72 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  35.97 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  39.42 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  35.25 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  35.34 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  33.62 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  42.86 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  30.43 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  35.61 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  31.25 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  32.76 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  42.11 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  38.95 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  35.19 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  31.11 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  43.86 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  43.86 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  43.86 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  37.74 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  36.79 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  44.74 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  34.74 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  38.79 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  38.79 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  37.74 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0201  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  35.48 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  30.37 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  34.91 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.14 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  30.94 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  35.78 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  36.7 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  35.85 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  31.82 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  32.82 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  35.29 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  33.61 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  30 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  36.08 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  35.9 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  32.37 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  32.08 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  32.65 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  30.6 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  41.28 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  41.28 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  31.78 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  29.23 
 
 		 139 aa  44.3  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  30.15 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  34.07 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  36.17 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  32.67 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>