122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1253 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1253  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 135 aa  276  9e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0603  hypothetical protein  94.07 
 
 		 135 aa  261  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1967  GLCG protein  69.92 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.282053 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  69.17 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  68.42 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  63.91 
 
 		 135 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  63.91 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  63.16 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  62.41 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  60.15 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  60.9 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  60.9 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  60.66 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  57.89 
 
 		 135 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  57.69 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  58.65 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1803  protein of unknown function DUF336  59.4 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  58.2 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  58.2 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  55.64 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2239  hypothetical protein  59.4 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  56.72 
 
 		 141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2281  hypothetical protein  61.65 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134622  normal  0.0127263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  58.65 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  51.13 
 
 		 134 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  51.13 
 
 		 134 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  59.17 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  51.13 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  51.13 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  54.26 
 
 		 134 aa  140  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  55.74 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  54.92 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  51.88 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  51.13 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2222  hypothetical protein  59.4 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0174781 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  56.39 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  57.26 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  57.26 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  57.26 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  57.26 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  57.26 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  57.26 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  57.26 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  53.28 
 
 		 133 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  56.56 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  50.82 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6129  GlcG protein  55.04 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3055  hypothetical protein  56.92 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170433 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  56.56 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  56.56 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  56.56 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  56.56 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  56.56 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  56.56 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  56.56 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  56.56 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70650  putative GlcG protein  52.71 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2303  hypothetical protein  54.92 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  50.46 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  47.57 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  37.88 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  40.3 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  41.22 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  40.8 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  34.71 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  31.3 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  33.96 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  36.36 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  34.33 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  30 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  31.01 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  32.14 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  29.46 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  29.55 
 
 		 178 aa  50.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  31.82 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  31.54 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  33.09 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  27.82 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  32.31 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  35.42 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  32.2 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  32.73 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  32.17 
 
 		 207 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  32.33 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  29.91 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  31.53 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0432  hypothetical protein  39.47 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  29.63 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  28.24 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  33.61 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  31.45 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  32.84 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  33.03 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  31.36 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  27.74 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  29.91 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  28.99 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  31.62 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  37.08 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  31.62 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>