More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2173 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  99.7 
 
 
336 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  100 
 
 
336 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  99.11 
 
 
336 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  98.21 
 
 
336 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  99.7 
 
 
336 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  76.56 
 
 
335 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.84 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1737  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.86 
 
 
195 aa  160  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1009  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.27 
 
 
170 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000622248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1178  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.67 
 
 
170 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.341742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.18 
 
 
186 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.76 
 
 
188 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.2 
 
 
191 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.86 
 
 
182 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.45 
 
 
185 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  42.49 
 
 
190 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.88 
 
 
192 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.9 
 
 
187 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.61 
 
 
179 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.82 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  45.18 
 
 
183 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.25 
 
 
185 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1533  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.38 
 
 
193 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000827294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.25 
 
 
185 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1388  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.38 
 
 
193 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00323474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1499  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.38 
 
 
193 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000121183  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.42 
 
 
178 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.78 
 
 
185 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.09 
 
 
192 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.2 
 
 
193 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3022  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.83 
 
 
179 aa  129  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
191 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.51 
 
 
192 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0130  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.24 
 
 
174 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2349  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.45 
 
 
177 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.952364  normal  0.0113032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.53 
 
 
191 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.57 
 
 
192 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.11 
 
 
189 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.57 
 
 
195 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1401  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.2 
 
 
193 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1603  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  42.26 
 
 
193 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  41.57 
 
 
190 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.71 
 
 
191 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  38.42 
 
 
190 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
192 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.64 
 
 
185 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1361  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000348693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.56 
 
 
192 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.26 
 
 
193 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.01 
 
 
187 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.73 
 
 
189 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
192 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1571  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.26 
 
 
193 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1084899999999994e-45 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.77 
 
 
190 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.24 
 
 
190 aa  124  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.78 
 
 
191 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.35 
 
 
192 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.12 
 
 
186 aa  123  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.25 
 
 
190 aa  122  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.09 
 
 
190 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  46.01 
 
 
181 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.61 
 
 
190 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  43.35 
 
 
190 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.47 
 
 
184 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.79 
 
 
194 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.07 
 
 
195 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.07 
 
 
195 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2316  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.37 
 
 
177 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.29 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.28 
 
 
190 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.42 
 
 
189 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.94 
 
 
184 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1162  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  40.36 
 
 
188 aa  119  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0392  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.61 
 
 
177 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.499168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  41.86 
 
 
190 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  44.05 
 
 
190 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  38.92 
 
 
184 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.32 
 
 
191 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  48.31 
 
 
170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.93 
 
 
190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0880  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.24 
 
 
176 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1904  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.82 
 
 
177 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  42.69 
 
 
192 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.5 
 
 
192 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0098  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.94 
 
 
174 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.552457  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  44.17 
 
 
184 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2492  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.24 
 
 
187 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  46.09 
 
 
167 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  42.5 
 
 
139 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.8 
 
 
157 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  42.44 
 
 
192 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.45 
 
 
187 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  42.11 
 
 
192 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1511  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.48 
 
 
190 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.26 
 
 
193 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.6 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  42.44 
 
 
192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  42.11 
 
 
192 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02439  putative vitamin B12 related Cobalamin adenosyltransferase  37.72 
 
 
171 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>