213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3302 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  59.57 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  55.49 
 
 
182 aa  214  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.68 
 
 
189 aa  209  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.05 
 
 
187 aa  208  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  50.8 
 
 
190 aa  201  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  49.72 
 
 
184 aa  192  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  49.15 
 
 
183 aa  177  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.7 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.01 
 
 
191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.26 
 
 
188 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.08 
 
 
191 aa  161  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.24 
 
 
185 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.11 
 
 
187 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.9 
 
 
179 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.24 
 
 
185 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.24 
 
 
185 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  44.02 
 
 
190 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.62 
 
 
190 aa  154  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.32 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.65 
 
 
187 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
190 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.05 
 
 
193 aa  148  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  42.46 
 
 
184 aa  147  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1401  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.6 
 
 
193 aa  147  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.72 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.99 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.65 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.53 
 
 
191 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1533  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.51 
 
 
193 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000827294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.32 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.96 
 
 
192 aa  144  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.56 
 
 
187 aa  144  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  42.13 
 
 
194 aa  144  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1388  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.96 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00323474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1499  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.96 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000121183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.51 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1603  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.51 
 
 
193 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  44.51 
 
 
193 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  40.72 
 
 
195 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1361  hypothetical protein  43.96 
 
 
193 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000348693  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1511  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.11 
 
 
190 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.72 
 
 
195 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  45.18 
 
 
336 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  45.18 
 
 
336 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  45.18 
 
 
336 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.3 
 
 
197 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  45.18 
 
 
336 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.96 
 
 
192 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1571  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.51 
 
 
193 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1084899999999994e-45 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.3 
 
 
190 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  42.54 
 
 
335 aa  141  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.18 
 
 
190 aa  140  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  44.58 
 
 
336 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  40.74 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  39.68 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1009  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.24 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000622248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1178  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.85 
 
 
170 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.341742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.44 
 
 
184 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5373  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.05 
 
 
194 aa  138  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1737  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.44 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.71 
 
 
190 aa  137  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.89 
 
 
191 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.53 
 
 
192 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.74 
 
 
190 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.49 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.36 
 
 
192 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.17 
 
 
190 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.32 
 
 
190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.89 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  40.43 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  39.25 
 
 
190 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.21 
 
 
196 aa  134  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.62 
 
 
189 aa  134  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.33 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.46 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.58 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02439  putative vitamin B12 related Cobalamin adenosyltransferase  39.89 
 
 
171 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4487  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.08 
 
 
192 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0463352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.32 
 
 
190 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.89 
 
 
190 aa  131  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.22 
 
 
184 aa  131  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.51 
 
 
196 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.36 
 
 
197 aa  130  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.43 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.62 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.89 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  39.25 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.71 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.89 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.33 
 
 
183 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.98 
 
 
183 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1076  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.12 
 
 
191 aa  129  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.17 
 
 
190 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.04 
 
 
190 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.72 
 
 
187 aa  129  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  38.5 
 
 
192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.33 
 
 
183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  39.33 
 
 
183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.33 
 
 
183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>