213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1975 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  100 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  100 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  87.76 
 
 
196 aa  332  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  73.33 
 
 
192 aa  291  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  72.82 
 
 
192 aa  289  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  72.82 
 
 
190 aa  287  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  70.77 
 
 
192 aa  286  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  73.85 
 
 
192 aa  285  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  71.79 
 
 
190 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  71.28 
 
 
191 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  65.64 
 
 
192 aa  270  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  71.79 
 
 
190 aa  268  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  71.28 
 
 
197 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  70.26 
 
 
191 aa  262  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  64.47 
 
 
196 aa  255  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.83 
 
 
196 aa  244  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  65.13 
 
 
190 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.56 
 
 
192 aa  244  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  62.56 
 
 
195 aa  243  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.56 
 
 
193 aa  241  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  61.73 
 
 
190 aa  240  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  61.73 
 
 
190 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  61.22 
 
 
190 aa  237  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  63.27 
 
 
190 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.12 
 
 
190 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  61.93 
 
 
190 aa  230  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.93 
 
 
190 aa  230  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.39 
 
 
192 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  60.91 
 
 
190 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  58.88 
 
 
192 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  58.88 
 
 
192 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  58.38 
 
 
190 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.41 
 
 
191 aa  208  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.63 
 
 
190 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.92 
 
 
186 aa  194  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.38 
 
 
189 aa  194  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.58 
 
 
198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.81 
 
 
190 aa  180  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.31 
 
 
195 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1221  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.75 
 
 
199 aa  176  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.05 
 
 
191 aa  175  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.14 
 
 
188 aa  175  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.51 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.79 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.24 
 
 
203 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
190 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
198 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.35 
 
 
179 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3076  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.49 
 
 
231 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.88 
 
 
185 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
190 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
190 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
190 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.23 
 
 
196 aa  168  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.7 
 
 
207 aa  168  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.77 
 
 
196 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
198 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.88 
 
 
185 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.88 
 
 
185 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.94 
 
 
190 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.48 
 
 
187 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.78 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.91 
 
 
184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18150  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.38 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.488735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.69 
 
 
191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3086  cobalamin adenosyltransferase  54.77 
 
 
193 aa  161  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.03 
 
 
203 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.68 
 
 
191 aa  158  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.63 
 
 
190 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  48.66 
 
 
190 aa  157  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  48.94 
 
 
194 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11341  hypothetical protein  50.52 
 
 
193 aa  155  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000044047  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.09 
 
 
189 aa  154  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.67 
 
 
184 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.6 
 
 
191 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.15 
 
 
190 aa  151  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  45.55 
 
 
184 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.86 
 
 
178 aa  149  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.15 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.81 
 
 
191 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  47.34 
 
 
181 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.41 
 
 
192 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.81 
 
 
183 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.72 
 
 
186 aa  142  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  43.32 
 
 
184 aa  142  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.07 
 
 
191 aa  141  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.84 
 
 
184 aa  141  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.71 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.91 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547441  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.88 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.2 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1603  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  45.2 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  45.76 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1571  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.2 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1084899999999994e-45 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.55 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.62 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1533  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.2 
 
 
193 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000827294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>