210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4132 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
207 aa  414  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  75.26 
 
 
190 aa  281  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  71.28 
 
 
190 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  69.31 
 
 
190 aa  264  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.2 
 
 
191 aa  262  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  66.32 
 
 
191 aa  258  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  65.24 
 
 
190 aa  255  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  65.24 
 
 
190 aa  255  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  66.67 
 
 
198 aa  255  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.71 
 
 
190 aa  254  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  66.67 
 
 
190 aa  251  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.52 
 
 
198 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11341  hypothetical protein  65.43 
 
 
193 aa  238  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000044047  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  62.77 
 
 
198 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  61.62 
 
 
203 aa  237  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  66.84 
 
 
190 aa  237  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.71 
 
 
191 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  63.35 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  62.96 
 
 
195 aa  229  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  65.28 
 
 
203 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.55 
 
 
190 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  62.9 
 
 
196 aa  225  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1221  ATP/cobalamin adenosyltransferase  61.42 
 
 
199 aa  224  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  66.49 
 
 
190 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  60.22 
 
 
196 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18150  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.11 
 
 
216 aa  209  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.488735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  57.59 
 
 
184 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.67 
 
 
191 aa  181  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.63 
 
 
190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.58 
 
 
192 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.11 
 
 
190 aa  174  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.05 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
195 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  48.7 
 
 
195 aa  168  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.63 
 
 
191 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.7 
 
 
195 aa  168  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.08 
 
 
186 aa  168  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.78 
 
 
190 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.05 
 
 
192 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.88 
 
 
191 aa  166  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.42 
 
 
192 aa  165  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.05 
 
 
192 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.68 
 
 
190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
190 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.05 
 
 
192 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
197 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  48.68 
 
 
190 aa  159  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
190 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  48.15 
 
 
190 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.3 
 
 
196 aa  158  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.78 
 
 
189 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.62 
 
 
190 aa  158  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
190 aa  157  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.92 
 
 
190 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  46.32 
 
 
192 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  47.62 
 
 
190 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.45 
 
 
196 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
191 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.68 
 
 
193 aa  148  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  44.97 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  48.68 
 
 
183 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.96 
 
 
178 aa  142  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
185 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
185 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  44.74 
 
 
184 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.55 
 
 
185 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.83 
 
 
191 aa  141  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.18 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  48.95 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.95 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.95 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.21 
 
 
184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.95 
 
 
183 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.29 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.29 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.63 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.29 
 
 
191 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.29 
 
 
191 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.29 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.29 
 
 
191 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.37 
 
 
242 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.95 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.89 
 
 
191 aa  138  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  49.14 
 
 
194 aa  138  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.95 
 
 
183 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.27 
 
 
189 aa  138  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.67 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  48.17 
 
 
187 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.67 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  46.94 
 
 
185 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
190 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.13 
 
 
189 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.11 
 
 
187 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.59 
 
 
192 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.13 
 
 
189 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
188 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>