212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3559 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  91.67 
 
 
192 aa  359  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  75.52 
 
 
192 aa  301  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  75 
 
 
192 aa  292  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  72.82 
 
 
195 aa  289  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  72.82 
 
 
195 aa  289  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  72.96 
 
 
196 aa  269  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  70.83 
 
 
190 aa  267  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  69.79 
 
 
191 aa  265  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  68.21 
 
 
195 aa  262  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  71.88 
 
 
191 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.19 
 
 
190 aa  257  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  67.36 
 
 
192 aa  254  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.71 
 
 
190 aa  253  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  64.29 
 
 
196 aa  252  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  64.06 
 
 
192 aa  250  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.62 
 
 
193 aa  249  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  67.19 
 
 
190 aa  247  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  65.62 
 
 
190 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  66.67 
 
 
190 aa  244  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  63.54 
 
 
190 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  68.23 
 
 
190 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  64.06 
 
 
190 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.82 
 
 
196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  64.58 
 
 
190 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.71 
 
 
197 aa  241  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  59.79 
 
 
190 aa  216  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  58.33 
 
 
191 aa  210  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.73 
 
 
190 aa  205  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.22 
 
 
192 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.7 
 
 
192 aa  204  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.19 
 
 
192 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.9 
 
 
190 aa  201  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.38 
 
 
186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.56 
 
 
191 aa  184  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.97 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  57.44 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.36 
 
 
195 aa  180  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.19 
 
 
198 aa  178  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.12 
 
 
189 aa  177  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.85 
 
 
191 aa  176  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.58 
 
 
207 aa  175  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.04 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1221  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.06 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.04 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.06 
 
 
191 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.81 
 
 
195 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  57.14 
 
 
188 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.12 
 
 
198 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.28 
 
 
191 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.89 
 
 
185 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.95 
 
 
179 aa  168  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.32 
 
 
185 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18150  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.8 
 
 
216 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.488735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.3 
 
 
196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.4 
 
 
191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  51.89 
 
 
194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.85 
 
 
185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.85 
 
 
185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11341  hypothetical protein  53.93 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000044047  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.4 
 
 
196 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.74 
 
 
203 aa  161  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3076  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.13 
 
 
231 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.37 
 
 
190 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.44 
 
 
198 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
190 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
190 aa  155  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.15 
 
 
184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3086  cobalamin adenosyltransferase  55.9 
 
 
193 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.17 
 
 
189 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  49.48 
 
 
185 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.15 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.89 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.13 
 
 
189 aa  151  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1603  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  49.43 
 
 
193 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.65 
 
 
187 aa  149  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.43 
 
 
193 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.91 
 
 
190 aa  148  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547441  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.08 
 
 
190 aa  147  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
185 aa  147  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
185 aa  147  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1537  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.32 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  49.73 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1388  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.73 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00323474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  48.86 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1499  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.73 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000121183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.86 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.79 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.45 
 
 
187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.51 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1533  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.73 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000827294  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  46.07 
 
 
184 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.48 
 
 
184 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1361  hypothetical protein  48.86 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000348693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.72 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>