212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4881 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4881  ATP  100 
 
 
190 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  82.11 
 
 
190 aa  321  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  80.53 
 
 
190 aa  318  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  79.47 
 
 
190 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  78.42 
 
 
190 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  81.05 
 
 
190 aa  309  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  77.37 
 
 
190 aa  299  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  70.83 
 
 
191 aa  262  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  67.71 
 
 
192 aa  256  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  69.27 
 
 
190 aa  256  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.1 
 
 
193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  68.75 
 
 
190 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  69.79 
 
 
191 aa  245  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  64.06 
 
 
192 aa  244  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  65.13 
 
 
195 aa  244  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  65.13 
 
 
195 aa  244  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  64.58 
 
 
192 aa  241  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  64.06 
 
 
192 aa  241  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  68.23 
 
 
190 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.71 
 
 
197 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  62.56 
 
 
195 aa  235  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.5 
 
 
192 aa  233  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.73 
 
 
196 aa  232  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  66.33 
 
 
196 aa  229  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  60.94 
 
 
192 aa  228  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  63.27 
 
 
196 aa  226  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  59.28 
 
 
190 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  58.76 
 
 
192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.22 
 
 
190 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.28 
 
 
192 aa  213  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.79 
 
 
190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  58.76 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.86 
 
 
190 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.29 
 
 
191 aa  203  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.69 
 
 
191 aa  203  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.48 
 
 
189 aa  192  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.08 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.69 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.44 
 
 
184 aa  181  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.01 
 
 
198 aa  181  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.01 
 
 
185 aa  178  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.31 
 
 
203 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3076  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.98 
 
 
231 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.41 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.7 
 
 
191 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.4 
 
 
198 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1221  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.26 
 
 
199 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.11 
 
 
190 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.33 
 
 
179 aa  168  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.44 
 
 
188 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.21 
 
 
190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
185 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
191 aa  164  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.21 
 
 
196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.21 
 
 
190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.08 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.21 
 
 
198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.42 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18150  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.31 
 
 
216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.488735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.69 
 
 
191 aa  161  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.13 
 
 
191 aa  161  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.42 
 
 
184 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  47.59 
 
 
184 aa  159  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.45 
 
 
187 aa  157  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.5 
 
 
189 aa  157  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  52.2 
 
 
194 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3086  cobalamin adenosyltransferase  53.03 
 
 
193 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.87 
 
 
189 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.55 
 
 
190 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547441  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.68 
 
 
190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.68 
 
 
191 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11341  hypothetical protein  49.47 
 
 
193 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000044047  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.28 
 
 
191 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.73 
 
 
203 aa  150  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.83 
 
 
187 aa  148  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.54 
 
 
187 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.72 
 
 
187 aa  147  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.97 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  42.78 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  41.21 
 
 
184 aa  145  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  50.82 
 
 
185 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  39.51 
 
 
214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.49 
 
 
214 aa  143  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.33 
 
 
178 aa  143  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.4 
 
 
183 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.18 
 
 
184 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.72 
 
 
185 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.56 
 
 
190 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40 
 
 
203 aa  142  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.79 
 
 
183 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.89 
 
 
183 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  45.6 
 
 
181 aa  141  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.3 
 
 
182 aa  141  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.34 
 
 
184 aa  141  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.34 
 
 
196 aa  140  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>