212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2549 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
190 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  75.79 
 
 
190 aa  294  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  72.63 
 
 
190 aa  278  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  72.11 
 
 
190 aa  275  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  70.53 
 
 
192 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  70.53 
 
 
192 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  70.53 
 
 
192 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  64.58 
 
 
191 aa  241  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  61.34 
 
 
190 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.46 
 
 
190 aa  231  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  63.02 
 
 
190 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  64.06 
 
 
191 aa  228  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  62.63 
 
 
195 aa  228  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  62.63 
 
 
195 aa  228  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.79 
 
 
190 aa  223  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  61.34 
 
 
190 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  59.79 
 
 
190 aa  220  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  60.82 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  63.54 
 
 
190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  63.54 
 
 
197 aa  218  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  59.28 
 
 
190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.5 
 
 
196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  60 
 
 
192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  58.97 
 
 
192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  57.22 
 
 
190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  57.07 
 
 
195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  57.73 
 
 
190 aa  210  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61 
 
 
196 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  58.97 
 
 
192 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  59.79 
 
 
192 aa  207  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.85 
 
 
196 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  57.44 
 
 
192 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  57.73 
 
 
192 aa  205  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  55.21 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.54 
 
 
189 aa  194  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.99 
 
 
191 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.32 
 
 
186 aa  191  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  55.44 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.04 
 
 
179 aa  177  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.91 
 
 
188 aa  175  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3076  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.19 
 
 
231 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1221  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.69 
 
 
199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.7 
 
 
191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.81 
 
 
190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.65 
 
 
190 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.5 
 
 
190 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.18 
 
 
187 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.04 
 
 
196 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.87 
 
 
185 aa  168  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.94 
 
 
185 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.94 
 
 
185 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.96 
 
 
191 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.31 
 
 
198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.38 
 
 
190 aa  165  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.75 
 
 
203 aa  164  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.95 
 
 
184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.79 
 
 
191 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.16 
 
 
189 aa  161  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.76 
 
 
203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.21 
 
 
184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  44.09 
 
 
190 aa  161  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
198 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.82 
 
 
187 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.04 
 
 
191 aa  158  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.4 
 
 
188 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  47.34 
 
 
184 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
191 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
190 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11341  hypothetical protein  52.04 
 
 
193 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000044047  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  48.63 
 
 
194 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18150  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.83 
 
 
216 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.488735 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
192 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
207 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
190 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
190 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  47.67 
 
 
192 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.67 
 
 
192 aa  154  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  44.02 
 
 
184 aa  154  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
185 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3086  cobalamin adenosyltransferase  54.92 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.54 
 
 
191 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.34 
 
 
188 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.3 
 
 
178 aa  150  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.49 
 
 
185 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.81 
 
 
188 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  48.63 
 
 
181 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.94 
 
 
194 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.78 
 
 
186 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.32 
 
 
189 aa  148  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.97 
 
 
195 aa  148  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
183 aa  147  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  45.83 
 
 
192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  47.12 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.2 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2316  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.89 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  46.35 
 
 
192 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.3 
 
 
190 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.77 
 
 
188 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>