212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3076 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3076  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  100 
 
 
231 aa  453  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.46 
 
 
193 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  49.1 
 
 
190 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  47.75 
 
 
190 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.33 
 
 
190 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  46.85 
 
 
190 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  47.98 
 
 
190 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.95 
 
 
192 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.75 
 
 
196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.5 
 
 
190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.64 
 
 
192 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.84 
 
 
190 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.19 
 
 
192 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.49 
 
 
195 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.49 
 
 
195 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.64 
 
 
190 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.02 
 
 
192 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.2 
 
 
190 aa  167  9e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.39 
 
 
190 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.35 
 
 
190 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  44.25 
 
 
192 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.26 
 
 
190 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.71 
 
 
196 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.78 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.25 
 
 
191 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.25 
 
 
195 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.98 
 
 
192 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.13 
 
 
192 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.26 
 
 
196 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.13 
 
 
192 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.25 
 
 
191 aa  154  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.98 
 
 
197 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.19 
 
 
190 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.9 
 
 
190 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.25 
 
 
191 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.05 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.99 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.29 
 
 
185 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.1 
 
 
191 aa  143  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.23 
 
 
190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.53 
 
 
187 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.89 
 
 
184 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44 
 
 
190 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.63 
 
 
192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.45 
 
 
191 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.56 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.73 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  38.94 
 
 
184 aa  132  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.63 
 
 
190 aa  131  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.85 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.18 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.23 
 
 
188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1401  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.91 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.81 
 
 
191 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
207 aa  128  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.65 
 
 
186 aa  128  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1571  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.37 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1084899999999994e-45 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.27 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.18 
 
 
190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.73 
 
 
190 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.73 
 
 
190 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  34.7 
 
 
182 aa  125  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.91 
 
 
193 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.46 
 
 
193 aa  124  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1603  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.91 
 
 
193 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.81 
 
 
191 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.96 
 
 
198 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  36.94 
 
 
190 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.84 
 
 
196 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18150  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.98 
 
 
216 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.488735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  37.84 
 
 
179 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  36.07 
 
 
187 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  37.78 
 
 
192 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  38.46 
 
 
193 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.76 
 
 
185 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  36.94 
 
 
184 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.15 
 
 
190 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  35.16 
 
 
178 aa  122  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.48 
 
 
191 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1361  hypothetical protein  38.46 
 
 
193 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000348693  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  34.25 
 
 
189 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1533  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.46 
 
 
193 aa  121  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000827294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1388  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.46 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00323474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1499  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.46 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000121183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.29 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.57 
 
 
185 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.89 
 
 
188 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.57 
 
 
185 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.6 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.29 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  34.4 
 
 
186 aa  118  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.84 
 
 
196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  36.82 
 
 
184 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.82 
 
 
191 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.82 
 
 
191 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.82 
 
 
191 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  39.82 
 
 
190 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  37.99 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.84 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.14 
 
 
203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>