213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1099 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  59.57 
 
 
186 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  55.9 
 
 
190 aa  223  9e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  55.56 
 
 
187 aa  222  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  56.15 
 
 
182 aa  217  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.4 
 
 
189 aa  214  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  50.8 
 
 
184 aa  194  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.25 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.84 
 
 
191 aa  171  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.31 
 
 
185 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.24 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.31 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.31 
 
 
185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.34 
 
 
191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.31 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.24 
 
 
179 aa  159  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
185 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.35 
 
 
190 aa  154  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
188 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.26 
 
 
190 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.52 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.85 
 
 
187 aa  151  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.03 
 
 
191 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.23 
 
 
193 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  44.62 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.01 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1401  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.71 
 
 
193 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1009  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.78 
 
 
170 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000622248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1178  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.78 
 
 
170 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.341742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1388  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.19 
 
 
193 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00323474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1499  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.19 
 
 
193 aa  143  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000121183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.77 
 
 
191 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1533  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.19 
 
 
193 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000827294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1603  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  41.67 
 
 
193 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.58 
 
 
195 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.02 
 
 
189 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.45 
 
 
192 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
190 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
197 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  43.01 
 
 
190 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.55 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.15 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1571  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.67 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1084899999999994e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  41.15 
 
 
193 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  42.86 
 
 
190 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.5 
 
 
185 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.74 
 
 
198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.09 
 
 
186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.32 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1361  hypothetical protein  40.62 
 
 
193 aa  138  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000348693  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  42.39 
 
 
194 aa  137  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.68 
 
 
190 aa  137  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.08 
 
 
192 aa  137  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  41.15 
 
 
195 aa  137  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.15 
 
 
195 aa  137  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  41.62 
 
 
184 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  44.62 
 
 
190 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.46 
 
 
203 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  44.27 
 
 
192 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3022  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.96 
 
 
179 aa  136  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.04 
 
 
193 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  39.68 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.05 
 
 
195 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.18 
 
 
184 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.62 
 
 
190 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.47 
 
 
190 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.09 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.54 
 
 
178 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.32 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.92 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.33 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.11 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.01 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.27 
 
 
333 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.21 
 
 
196 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.11 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.83 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  40.88 
 
 
336 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  40.88 
 
 
336 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  40.88 
 
 
336 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  40.88 
 
 
336 aa  131  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1511  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.08 
 
 
190 aa  131  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  40.88 
 
 
336 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  40.22 
 
 
181 aa  130  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.55 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  40.35 
 
 
335 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.97 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.64 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02439  putative vitamin B12 related Cobalamin adenosyltransferase  39.67 
 
 
171 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.53 
 
 
191 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.53 
 
 
191 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.53 
 
 
191 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  41.53 
 
 
190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  41.53 
 
 
190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.3 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  41.53 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  41.53 
 
 
190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.58 
 
 
192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1725  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.38 
 
 
188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  40.76 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>