210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1264 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
203 aa  418  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.34 
 
 
214 aa  255  4e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  57.08 
 
 
214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.69 
 
 
185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.15 
 
 
187 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.6 
 
 
189 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.9 
 
 
194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.92 
 
 
242 aa  165  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  43.88 
 
 
190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  43.88 
 
 
190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  43.88 
 
 
190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.88 
 
 
191 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.88 
 
 
191 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  43.88 
 
 
187 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.88 
 
 
191 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.15 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  43.37 
 
 
183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.06 
 
 
190 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.6 
 
 
188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.88 
 
 
183 aa  161  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.63 
 
 
184 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.37 
 
 
183 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.08 
 
 
192 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  44.39 
 
 
183 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.39 
 
 
183 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.39 
 
 
183 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.37 
 
 
183 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.07 
 
 
190 aa  158  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.41 
 
 
184 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  44.56 
 
 
192 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.08 
 
 
189 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  43.81 
 
 
185 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  45.36 
 
 
192 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.52 
 
 
184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.52 
 
 
194 aa  154  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.33 
 
 
185 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.33 
 
 
185 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.04 
 
 
190 aa  153  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  45.36 
 
 
192 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  42.78 
 
 
192 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  43.01 
 
 
192 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.56 
 
 
189 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.52 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.37 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.49 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.95 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.43 
 
 
190 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40 
 
 
196 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  43.01 
 
 
184 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  44.39 
 
 
181 aa  147  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.01 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.04 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  38.97 
 
 
190 aa  145  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.97 
 
 
197 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.71 
 
 
185 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.62 
 
 
183 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.82 
 
 
191 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.45 
 
 
197 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.45 
 
 
190 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.59 
 
 
202 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  40 
 
 
190 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.97 
 
 
190 aa  141  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.97 
 
 
198 aa  141  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.97 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.42 
 
 
193 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1076  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.33 
 
 
191 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3773  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.33 
 
 
192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0185512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.31 
 
 
191 aa  138  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.79 
 
 
191 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  37.95 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.41 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.41 
 
 
188 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.95 
 
 
190 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.46 
 
 
192 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  38.46 
 
 
190 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.1 
 
 
192 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42 
 
 
192 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44 
 
 
191 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.91 
 
 
187 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.45 
 
 
189 aa  134  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.54 
 
 
186 aa  134  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.5 
 
 
191 aa  134  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  40.91 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.1 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.69 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.89 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.89 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  36.41 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.5 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1725  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.31 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.33 
 
 
185 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3660  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.85 
 
 
191 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0197114  normal  0.165912 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  40.4 
 
 
195 aa  131  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.4 
 
 
195 aa  131  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.13 
 
 
191 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.24 
 
 
182 aa  131  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.9 
 
 
187 aa  131  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>