213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2663 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  89.67 
 
 
185 aa  333  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  89.67 
 
 
185 aa  333  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  81.32 
 
 
184 aa  295  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  80.11 
 
 
188 aa  290  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  79.56 
 
 
242 aa  290  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  79.01 
 
 
183 aa  289  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  78.8 
 
 
184 aa  288  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  79.56 
 
 
183 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  79.56 
 
 
183 aa  287  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  79.56 
 
 
183 aa  287  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  79.56 
 
 
183 aa  287  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  79.56 
 
 
183 aa  286  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  79.56 
 
 
183 aa  286  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  80.11 
 
 
187 aa  284  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  80.11 
 
 
191 aa  284  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  80.11 
 
 
191 aa  284  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  80.11 
 
 
191 aa  284  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  80.11 
 
 
190 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  80.11 
 
 
190 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  80.11 
 
 
190 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  75.69 
 
 
192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  78.45 
 
 
191 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  68.45 
 
 
189 aa  262  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  66.85 
 
 
197 aa  247  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  66.3 
 
 
202 aa  243  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  66.3 
 
 
190 aa  243  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  65.19 
 
 
190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  68.51 
 
 
189 aa  239  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.64 
 
 
196 aa  238  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  64.09 
 
 
190 aa  238  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  67.96 
 
 
198 aa  234  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1498  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.88 
 
 
173 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.576361  normal  0.890005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0942  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.57 
 
 
191 aa  226  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  64.84 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  62.16 
 
 
192 aa  217  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  58.89 
 
 
191 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  59.78 
 
 
185 aa  209  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.84 
 
 
185 aa  208  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  57.14 
 
 
185 aa  207  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  58.99 
 
 
184 aa  206  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  59.32 
 
 
189 aa  205  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  55.98 
 
 
194 aa  205  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3773  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.71 
 
 
192 aa  205  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0185512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  58.99 
 
 
184 aa  204  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.83 
 
 
187 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.59 
 
 
189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  57.92 
 
 
184 aa  190  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  53.59 
 
 
181 aa  182  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.59 
 
 
188 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.78 
 
 
192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  50.54 
 
 
192 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.91 
 
 
189 aa  164  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
190 aa  161  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  51.61 
 
 
192 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  51.61 
 
 
192 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.04 
 
 
188 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
192 aa  158  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.7 
 
 
187 aa  157  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.81 
 
 
191 aa  156  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.49 
 
 
188 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.93 
 
 
188 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
190 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.81 
 
 
203 aa  155  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  42.72 
 
 
214 aa  154  9e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.59 
 
 
198 aa  151  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.72 
 
 
214 aa  150  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.99 
 
 
195 aa  148  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.75 
 
 
191 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
190 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
190 aa  147  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.85 
 
 
190 aa  147  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.55 
 
 
186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.83 
 
 
190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  47.8 
 
 
190 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
191 aa  145  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.28 
 
 
184 aa  144  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  50.82 
 
 
190 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.83 
 
 
198 aa  144  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  48.65 
 
 
190 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
192 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.18 
 
 
191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.45 
 
 
190 aa  144  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.84 
 
 
195 aa  144  9e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.62 
 
 
191 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.65 
 
 
190 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.9 
 
 
185 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
197 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.48 
 
 
178 aa  141  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.2 
 
 
190 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3660  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
191 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0197114  normal  0.165912 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.11 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.95 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.98 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.81 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.2 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>