212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0818 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
190 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  87.89 
 
 
190 aa  347  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  83.16 
 
 
190 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  82.11 
 
 
190 aa  322  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  78.42 
 
 
190 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  78.95 
 
 
190 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  77.37 
 
 
190 aa  301  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  69.79 
 
 
191 aa  263  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  68.75 
 
 
192 aa  261  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  64.58 
 
 
193 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.62 
 
 
192 aa  246  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  65.13 
 
 
195 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.62 
 
 
190 aa  245  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.62 
 
 
190 aa  245  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  68.23 
 
 
191 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  65.62 
 
 
192 aa  242  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  64.06 
 
 
192 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  61.73 
 
 
195 aa  240  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  63.54 
 
 
192 aa  240  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  61.73 
 
 
195 aa  240  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.76 
 
 
196 aa  240  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  64.97 
 
 
196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  65.1 
 
 
190 aa  230  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  64.58 
 
 
197 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.44 
 
 
196 aa  225  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.86 
 
 
192 aa  224  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  59.9 
 
 
192 aa  223  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.79 
 
 
190 aa  222  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.34 
 
 
190 aa  222  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  60.82 
 
 
192 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  60.31 
 
 
190 aa  216  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  60.31 
 
 
192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  55.21 
 
 
191 aa  206  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.34 
 
 
190 aa  204  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.17 
 
 
191 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3076  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.1 
 
 
231 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.89 
 
 
189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  55.56 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.94 
 
 
190 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.12 
 
 
190 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.65 
 
 
186 aa  175  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.28 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.04 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.16 
 
 
184 aa  171  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.25 
 
 
188 aa  170  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.88 
 
 
190 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1221  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.26 
 
 
199 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.95 
 
 
191 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.04 
 
 
195 aa  166  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.63 
 
 
185 aa  165  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.04 
 
 
196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.42 
 
 
191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
196 aa  164  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.31 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.69 
 
 
191 aa  161  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.04 
 
 
179 aa  160  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
191 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18150  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.78 
 
 
216 aa  156  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.488735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.5 
 
 
203 aa  155  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.62 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.66 
 
 
185 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.52 
 
 
189 aa  153  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.54 
 
 
191 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.66 
 
 
185 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.66 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  46.52 
 
 
184 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.81 
 
 
187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
189 aa  150  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.56 
 
 
191 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.58 
 
 
190 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  49.12 
 
 
194 aa  148  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.87 
 
 
190 aa  148  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547441  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.44 
 
 
187 aa  148  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.03 
 
 
187 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11341  hypothetical protein  51.04 
 
 
193 aa  145  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000044047  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3086  cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
193 aa  143  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  42.49 
 
 
190 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.68 
 
 
184 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  47.25 
 
 
181 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.12 
 
 
187 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.4 
 
 
182 aa  141  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.68 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.34 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  40 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.17 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.62 
 
 
190 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.33 
 
 
178 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.99 
 
 
185 aa  137  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.02 
 
 
214 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.62 
 
 
192 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  46.45 
 
 
185 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.19 
 
 
193 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.79 
 
 
183 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.45 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.15 
 
 
184 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>