212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3905 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  56.77 
 
 
190 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.29 
 
 
190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  56.25 
 
 
190 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.02 
 
 
191 aa  208  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  55.21 
 
 
190 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.77 
 
 
192 aa  205  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.12 
 
 
192 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.12 
 
 
192 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.12 
 
 
192 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  54.69 
 
 
190 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.15 
 
 
190 aa  198  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.65 
 
 
193 aa  195  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.92 
 
 
190 aa  194  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.12 
 
 
190 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.88 
 
 
191 aa  193  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  53.12 
 
 
190 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.88 
 
 
190 aa  192  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.12 
 
 
190 aa  191  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.6 
 
 
192 aa  191  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.45 
 
 
191 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.83 
 
 
190 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.57 
 
 
196 aa  184  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.56 
 
 
192 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.26 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.69 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.33 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.21 
 
 
190 aa  181  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.97 
 
 
190 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.97 
 
 
190 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.59 
 
 
196 aa  179  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.48 
 
 
192 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.4 
 
 
190 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.4 
 
 
197 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.31 
 
 
190 aa  175  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.05 
 
 
186 aa  174  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.89 
 
 
189 aa  174  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  48.44 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1221  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.75 
 
 
199 aa  171  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.17 
 
 
191 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.72 
 
 
188 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.28 
 
 
187 aa  168  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  168  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.72 
 
 
191 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.93 
 
 
178 aa  166  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
195 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.38 
 
 
184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.88 
 
 
207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.49 
 
 
203 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.45 
 
 
190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  48.11 
 
 
184 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  49.72 
 
 
183 aa  162  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.85 
 
 
190 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.69 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.28 
 
 
190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.28 
 
 
190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.28 
 
 
191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.49 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.28 
 
 
191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.28 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.28 
 
 
190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.28 
 
 
191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.2 
 
 
184 aa  161  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
191 aa  160  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
183 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.69 
 
 
196 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.31 
 
 
196 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.85 
 
 
185 aa  158  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.96 
 
 
198 aa  158  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.84 
 
 
191 aa  157  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.52 
 
 
242 aa  157  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.34 
 
 
183 aa  157  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.89 
 
 
185 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.39 
 
 
184 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.89 
 
 
185 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  46.81 
 
 
185 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
190 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.35 
 
 
188 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.48 
 
 
190 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.48 
 
 
190 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.48 
 
 
190 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
183 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.41 
 
 
189 aa  155  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.96 
 
 
195 aa  154  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.51 
 
 
187 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
183 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.35 
 
 
192 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.49 
 
 
185 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
191 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
198 aa  150  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
191 aa  150  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18150  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.57 
 
 
216 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.488735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.57 
 
 
185 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.5 
 
 
189 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.68 
 
 
194 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>