211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0666 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  66.84 
 
 
187 aa  244  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2492  ATP/cobalamin adenosyltransferase  62.63 
 
 
187 aa  224  7e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.91 
 
 
185 aa  187  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.72 
 
 
179 aa  177  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.37 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.95 
 
 
188 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.04 
 
 
190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
187 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.89 
 
 
185 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.37 
 
 
185 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.37 
 
 
185 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  48.66 
 
 
195 aa  157  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
192 aa  157  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.66 
 
 
195 aa  157  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.54 
 
 
192 aa  157  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.08 
 
 
189 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.57 
 
 
191 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.02 
 
 
186 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
192 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.36 
 
 
187 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.96 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.31 
 
 
178 aa  151  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1946  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.19 
 
 
191 aa  150  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.96 
 
 
192 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.44 
 
 
191 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  42.27 
 
 
190 aa  149  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.4 
 
 
196 aa  148  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.6 
 
 
190 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.26 
 
 
191 aa  148  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.8 
 
 
192 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1401  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.86 
 
 
193 aa  147  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.26 
 
 
191 aa  147  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
190 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.73 
 
 
193 aa  147  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1603  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  48 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  43.41 
 
 
183 aa  145  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.76 
 
 
182 aa  145  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
190 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.13 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1511  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.7 
 
 
190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1533  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.89 
 
 
193 aa  144  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000827294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1388  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.89 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00323474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1499  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.89 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000121183  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1725  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.83 
 
 
188 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.43 
 
 
193 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.78 
 
 
190 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.6 
 
 
190 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.12 
 
 
191 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1571  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.43 
 
 
193 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1084899999999994e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  47.43 
 
 
193 aa  142  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.03 
 
 
195 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.68 
 
 
196 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.78 
 
 
197 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1361  hypothetical protein  46.86 
 
 
193 aa  141  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000348693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.48 
 
 
191 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  46.45 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  45.55 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.19 
 
 
189 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1009  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  43.27 
 
 
170 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000622248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.57 
 
 
190 aa  137  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  44.68 
 
 
184 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  44.62 
 
 
192 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1178  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.69 
 
 
170 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.341742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5373  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.5 
 
 
194 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.6 
 
 
193 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  43.98 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.68 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.93 
 
 
190 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.93 
 
 
190 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.96 
 
 
191 aa  134  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  42.63 
 
 
184 aa  134  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  45.16 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.37 
 
 
190 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.39 
 
 
190 aa  134  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.92 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.81 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.67 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.07 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.39 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.28 
 
 
196 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  41.92 
 
 
192 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  44.5 
 
 
190 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  42.7 
 
 
336 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  42.7 
 
 
336 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  42.7 
 
 
336 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  42.7 
 
 
336 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  43.17 
 
 
194 aa  131  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.33 
 
 
187 aa  131  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  42.7 
 
 
336 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.2 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.64 
 
 
185 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3022  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.62 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.7 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02439  putative vitamin B12 related Cobalamin adenosyltransferase  42.62 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2349  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.78 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.952364  normal  0.0113032 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.89 
 
 
192 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.71 
 
 
207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.2 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>