213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1592 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  59.22 
 
 
191 aa  202  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  59.22 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  57.3 
 
 
185 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.76 
 
 
185 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  56.76 
 
 
185 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  52.91 
 
 
190 aa  187  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  57.89 
 
 
190 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.19 
 
 
189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.19 
 
 
179 aa  181  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  53.01 
 
 
190 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.51 
 
 
187 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  55.91 
 
 
187 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.43 
 
 
193 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  51.91 
 
 
190 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
187 aa  174  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.09 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.35 
 
 
191 aa  173  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.27 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.32 
 
 
192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.22 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.89 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.7 
 
 
186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  49.16 
 
 
183 aa  170  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
190 aa  170  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.07 
 
 
189 aa  170  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.37 
 
 
178 aa  169  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  48.91 
 
 
184 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
190 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.81 
 
 
190 aa  167  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
191 aa  167  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.32 
 
 
192 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2492  ATP/cobalamin adenosyltransferase  55.32 
 
 
187 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
192 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  46.07 
 
 
190 aa  165  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  48.63 
 
 
190 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.51 
 
 
197 aa  164  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.51 
 
 
190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.23 
 
 
191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.53 
 
 
192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.76 
 
 
191 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
195 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1725  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.61 
 
 
188 aa  160  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.51 
 
 
182 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.19 
 
 
192 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  48.9 
 
 
184 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.65 
 
 
192 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.85 
 
 
191 aa  158  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.8 
 
 
185 aa  158  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
184 aa  158  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.11 
 
 
196 aa  157  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  52.25 
 
 
181 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.39 
 
 
186 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.89 
 
 
184 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.92 
 
 
195 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
192 aa  155  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.78 
 
 
196 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  53.89 
 
 
194 aa  154  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.57 
 
 
190 aa  153  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.87 
 
 
196 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.56 
 
 
183 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.84 
 
 
203 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.07 
 
 
192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.18 
 
 
190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.67 
 
 
191 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.56 
 
 
183 aa  151  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.57 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1533  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.56 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000827294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.12 
 
 
242 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.8 
 
 
191 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.37 
 
 
184 aa  150  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.44 
 
 
187 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.35 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45 
 
 
193 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1603  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  45 
 
 
193 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1388  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.56 
 
 
193 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00323474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1499  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.56 
 
 
193 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000121183  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  43.07 
 
 
214 aa  150  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.56 
 
 
190 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.56 
 
 
190 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
190 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.54 
 
 
188 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.56 
 
 
191 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.56 
 
 
191 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.56 
 
 
187 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.56 
 
 
190 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.56 
 
 
191 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.03 
 
 
189 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.67 
 
 
203 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1401  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.11 
 
 
193 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111413  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.06 
 
 
214 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.46 
 
 
198 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  45 
 
 
193 aa  148  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45 
 
 
193 aa  148  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.42 
 
 
198 aa  148  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1571  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45 
 
 
193 aa  148  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1084899999999994e-45 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>