213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0722 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  96.74 
 
 
188 aa  361  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  84.15 
 
 
192 aa  317  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  85.08 
 
 
242 aa  309  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  84.53 
 
 
183 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  84.53 
 
 
183 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  84.53 
 
 
183 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  83.43 
 
 
183 aa  306  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  82.61 
 
 
191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  82.61 
 
 
191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  82.61 
 
 
191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  82.61 
 
 
190 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  82.61 
 
 
190 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  82.61 
 
 
187 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  82.61 
 
 
190 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  82.32 
 
 
183 aa  298  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  81.77 
 
 
183 aa  296  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  81.32 
 
 
185 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  81.32 
 
 
185 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  81.32 
 
 
185 aa  295  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  81.77 
 
 
183 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  76.92 
 
 
191 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  76.09 
 
 
184 aa  278  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  68.85 
 
 
190 aa  257  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  66.67 
 
 
189 aa  257  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  69.06 
 
 
202 aa  252  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  68.51 
 
 
197 aa  251  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  66.67 
 
 
190 aa  251  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  66.67 
 
 
190 aa  249  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.29 
 
 
196 aa  243  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  67.76 
 
 
189 aa  241  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  67.76 
 
 
183 aa  236  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  68.85 
 
 
198 aa  236  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  65.24 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1498  ATP--cobalamin adenosyltransferase  63.91 
 
 
173 aa  227  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.576361  normal  0.890005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0942  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.95 
 
 
191 aa  224  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3773  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  68.45 
 
 
192 aa  223  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0185512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.44 
 
 
191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  60.11 
 
 
184 aa  218  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  58.29 
 
 
185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  57.38 
 
 
185 aa  210  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  58.01 
 
 
187 aa  211  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  58.43 
 
 
189 aa  210  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  59.56 
 
 
184 aa  209  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  56.04 
 
 
194 aa  204  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  57.3 
 
 
185 aa  203  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  60.11 
 
 
184 aa  201  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.55 
 
 
189 aa  192  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  55.25 
 
 
181 aa  191  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.93 
 
 
188 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  52.15 
 
 
192 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  48.39 
 
 
192 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  48.39 
 
 
192 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  48.92 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  51.08 
 
 
192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.2 
 
 
191 aa  161  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.51 
 
 
187 aa  161  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.39 
 
 
191 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
190 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.35 
 
 
214 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.83 
 
 
188 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.83 
 
 
188 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.83 
 
 
188 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
190 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
214 aa  156  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.18 
 
 
189 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.45 
 
 
203 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.1 
 
 
186 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.52 
 
 
203 aa  155  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.94 
 
 
198 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.35 
 
 
185 aa  150  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
198 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.09 
 
 
191 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.87 
 
 
191 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.67 
 
 
190 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.7 
 
 
190 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.21 
 
 
190 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
184 aa  148  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3660  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.72 
 
 
191 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0197114  normal  0.165912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.03 
 
 
190 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.9 
 
 
192 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.45 
 
 
190 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.51 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.61 
 
 
178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.57 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.45 
 
 
196 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.81 
 
 
190 aa  143  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.81 
 
 
196 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
191 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.9 
 
 
192 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1076  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.6 
 
 
191 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.84 
 
 
195 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.07 
 
 
183 aa  142  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.9 
 
 
192 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.56 
 
 
190 aa  141  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
193 aa  141  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.56 
 
 
197 aa  141  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.9 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>