213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0054 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  83.96 
 
 
189 aa  304  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  80 
 
 
190 aa  302  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  80.11 
 
 
197 aa  298  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  78.95 
 
 
190 aa  296  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  77.89 
 
 
190 aa  293  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  78.01 
 
 
192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  79.68 
 
 
198 aa  278  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0942  ATP--cobalamin adenosyltransferase  75.66 
 
 
191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  71.98 
 
 
184 aa  257  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  69.4 
 
 
188 aa  256  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.93 
 
 
192 aa  255  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  68.85 
 
 
184 aa  254  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  69.61 
 
 
191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3773  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  77.78 
 
 
192 aa  251  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0185512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  67.22 
 
 
185 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  67.22 
 
 
185 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  67.03 
 
 
183 aa  247  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.03 
 
 
183 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.03 
 
 
183 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  66.3 
 
 
185 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  66.48 
 
 
183 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  66.48 
 
 
183 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  66.48 
 
 
183 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  66.48 
 
 
242 aa  240  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  65.75 
 
 
183 aa  235  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  65.75 
 
 
187 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  65.75 
 
 
190 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  65.75 
 
 
190 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  65.75 
 
 
190 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  65.75 
 
 
191 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  65.75 
 
 
191 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  65.75 
 
 
191 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.7 
 
 
189 aa  232  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.69 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.76 
 
 
187 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1498  ATP--cobalamin adenosyltransferase  59.52 
 
 
173 aa  201  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.576361  normal  0.890005 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  58.92 
 
 
185 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  60.11 
 
 
183 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  57.69 
 
 
185 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.89 
 
 
191 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.62 
 
 
189 aa  191  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  56.28 
 
 
184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.85 
 
 
189 aa  184  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.49 
 
 
184 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  53.59 
 
 
194 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.35 
 
 
185 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.8 
 
 
184 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  50.28 
 
 
181 aa  169  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.28 
 
 
188 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50 
 
 
192 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
192 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  48.92 
 
 
192 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
194 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.06 
 
 
191 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  49.73 
 
 
192 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.55 
 
 
188 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.72 
 
 
188 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.72 
 
 
188 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  48.66 
 
 
192 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.51 
 
 
214 aa  145  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  42.22 
 
 
183 aa  144  8.000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.59 
 
 
203 aa  142  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.91 
 
 
178 aa  141  5e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.11 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.81 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  43.96 
 
 
184 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  40.19 
 
 
214 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1076  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.54 
 
 
191 aa  138  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  40.21 
 
 
190 aa  137  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.56 
 
 
188 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.57 
 
 
184 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.4 
 
 
190 aa  136  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.3 
 
 
186 aa  135  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.21 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.63 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.55 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.68 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3660  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0197114  normal  0.165912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.03 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.68 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.57 
 
 
198 aa  131  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.09 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.51 
 
 
185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.57 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.84 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.34 
 
 
207 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.62 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.38 
 
 
179 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.81 
 
 
191 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.23 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.7 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.68 
 
 
190 aa  128  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02439  putative vitamin B12 related Cobalamin adenosyltransferase  42.69 
 
 
171 aa  127  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.57 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  44.26 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.74 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1221  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.79 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.09 
 
 
203 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
190 aa  124  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>