212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1498 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1498  ATP--cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
173 aa  353  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.576361  normal  0.890005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  91.33 
 
 
189 aa  332  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  65.88 
 
 
185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  67.86 
 
 
191 aa  231  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  65.5 
 
 
183 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  65.29 
 
 
185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  65.29 
 
 
185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  63.01 
 
 
192 aa  228  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  63.31 
 
 
188 aa  227  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  63.91 
 
 
184 aa  227  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  66.08 
 
 
184 aa  226  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.12 
 
 
191 aa  227  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.12 
 
 
191 aa  227  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  64.12 
 
 
187 aa  227  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.12 
 
 
191 aa  227  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  63.74 
 
 
190 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  63.74 
 
 
190 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  63.74 
 
 
190 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.72 
 
 
242 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  63.31 
 
 
183 aa  223  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.72 
 
 
183 aa  221  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.72 
 
 
183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  62.13 
 
 
183 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.13 
 
 
183 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.13 
 
 
183 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.31 
 
 
197 aa  207  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  63.1 
 
 
189 aa  207  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.4 
 
 
196 aa  201  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  59.52 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  60.71 
 
 
190 aa  198  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  58.93 
 
 
190 aa  197  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  58.33 
 
 
190 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  58.14 
 
 
192 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  60.12 
 
 
198 aa  187  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.95 
 
 
185 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.49 
 
 
191 aa  181  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0942  ATP--cobalamin adenosyltransferase  58.05 
 
 
191 aa  181  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  56.8 
 
 
183 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.57 
 
 
187 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.66 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.91 
 
 
189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.4 
 
 
185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  50.29 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3773  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.93 
 
 
192 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0185512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50 
 
 
185 aa  157  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  48.52 
 
 
194 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.29 
 
 
189 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  45.14 
 
 
192 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  45.71 
 
 
192 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.82 
 
 
194 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.06 
 
 
184 aa  148  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.34 
 
 
188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.09 
 
 
191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.93 
 
 
188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.4 
 
 
191 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.39 
 
 
191 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  48.21 
 
 
181 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.75 
 
 
188 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.75 
 
 
188 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  45.56 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3660  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.65 
 
 
191 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0197114  normal  0.165912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  46.24 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.83 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  45.66 
 
 
192 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.91 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.83 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02439  putative vitamin B12 related Cobalamin adenosyltransferase  45.57 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.35 
 
 
186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1388  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.83 
 
 
193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00323474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1499  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.83 
 
 
193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000121183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1533  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.83 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000827294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.18 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1603  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.05 
 
 
193 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.95 
 
 
190 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  39.68 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.68 
 
 
214 aa  125  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.8 
 
 
187 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1571  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.08 
 
 
193 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1084899999999994e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.05 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.29 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44 
 
 
193 aa  124  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.03 
 
 
184 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  42.77 
 
 
190 aa  124  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44 
 
 
190 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  42.44 
 
 
183 aa  123  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1361  hypothetical protein  44.08 
 
 
193 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000348693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  44.08 
 
 
193 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.46 
 
 
198 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.41 
 
 
190 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.41 
 
 
190 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.2 
 
 
203 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.71 
 
 
190 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.13 
 
 
191 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.83 
 
 
193 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44 
 
 
190 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.41 
 
 
190 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.68 
 
 
190 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.46 
 
 
178 aa  123  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.38 
 
 
192 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.08 
 
 
190 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>