213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3660 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3660  ATP--cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
191 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0197114  normal  0.165912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  57.22 
 
 
192 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  57.22 
 
 
192 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  56.83 
 
 
184 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.91 
 
 
187 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
185 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.94 
 
 
191 aa  180  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  52.94 
 
 
183 aa  178  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.14 
 
 
188 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.91 
 
 
188 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  54.79 
 
 
192 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.55 
 
 
194 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.41 
 
 
191 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.41 
 
 
191 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  52.41 
 
 
187 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.41 
 
 
191 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  52.41 
 
 
190 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  52.41 
 
 
190 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  52.41 
 
 
190 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  52.15 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.15 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.13 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  53.72 
 
 
192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.59 
 
 
188 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.05 
 
 
188 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.23 
 
 
192 aa  170  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.72 
 
 
184 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  51.58 
 
 
194 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
185 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  53.19 
 
 
192 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
185 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
185 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.05 
 
 
189 aa  167  9e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.39 
 
 
196 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.94 
 
 
188 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
183 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.05 
 
 
242 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.69 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.69 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  50 
 
 
185 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.05 
 
 
191 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.69 
 
 
183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
197 aa  161  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
190 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
190 aa  158  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.03 
 
 
214 aa  155  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  41.75 
 
 
214 aa  155  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
202 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.85 
 
 
203 aa  155  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  48.66 
 
 
184 aa  154  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  48.92 
 
 
185 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.63 
 
 
191 aa  150  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0942  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.53 
 
 
191 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.59 
 
 
183 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.83 
 
 
188 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.4 
 
 
190 aa  144  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.85 
 
 
184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.34 
 
 
195 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.4 
 
 
189 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.57 
 
 
185 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.79 
 
 
187 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.19 
 
 
191 aa  140  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1498  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.26 
 
 
173 aa  140  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.576361  normal  0.890005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.57 
 
 
186 aa  140  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.15 
 
 
192 aa  140  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.21 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  46.67 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1076  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.65 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.68 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.62 
 
 
185 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  45.74 
 
 
195 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.37 
 
 
190 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
190 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3773  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.3 
 
 
192 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0185512 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
195 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.11 
 
 
191 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.21 
 
 
190 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.11 
 
 
192 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.62 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.45 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  45.5 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
192 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.21 
 
 
192 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.74 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.21 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.12 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.4 
 
 
191 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.62 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.88 
 
 
195 aa  132  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.68 
 
 
192 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  45.24 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>