213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_57180 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  97.92 
 
 
192 aa  352  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  75.39 
 
 
194 aa  291  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  73.82 
 
 
192 aa  285  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  74.35 
 
 
191 aa  285  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  73.3 
 
 
192 aa  283  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  74.87 
 
 
188 aa  277  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  75.39 
 
 
188 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  72.77 
 
 
192 aa  270  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  75.92 
 
 
188 aa  270  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  75 
 
 
188 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.91 
 
 
183 aa  191  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.11 
 
 
191 aa  190  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  54.3 
 
 
183 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.3 
 
 
183 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.3 
 
 
183 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.3 
 
 
242 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
185 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.76 
 
 
183 aa  184  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.76 
 
 
183 aa  184  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  53.23 
 
 
183 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.69 
 
 
189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.23 
 
 
191 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.23 
 
 
191 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.23 
 
 
191 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  53.23 
 
 
190 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  53.23 
 
 
190 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  53.23 
 
 
187 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  53.23 
 
 
190 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  52.15 
 
 
181 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
184 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.04 
 
 
187 aa  175  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
189 aa  175  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.53 
 
 
184 aa  174  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
185 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
185 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
190 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.27 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.88 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.48 
 
 
184 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  44.88 
 
 
214 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  52.15 
 
 
185 aa  170  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
189 aa  168  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.19 
 
 
192 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.66 
 
 
190 aa  168  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
191 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.2 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  48.92 
 
 
184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.65 
 
 
196 aa  164  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.69 
 
 
203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.13 
 
 
197 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.54 
 
 
185 aa  161  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
198 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  47.12 
 
 
194 aa  157  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3660  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.72 
 
 
191 aa  157  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0197114  normal  0.165912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
183 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.72 
 
 
185 aa  155  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.13 
 
 
189 aa  150  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.88 
 
 
190 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0942  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
191 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.33 
 
 
187 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.13 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.85 
 
 
178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.2 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
192 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  44.32 
 
 
184 aa  145  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.64 
 
 
189 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.07 
 
 
190 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.21 
 
 
183 aa  145  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.92 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.97 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1498  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.13 
 
 
173 aa  144  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.576361  normal  0.890005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.59 
 
 
187 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.11 
 
 
188 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.77 
 
 
184 aa  141  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.52 
 
 
185 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  46.59 
 
 
192 aa  141  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  45.16 
 
 
190 aa  140  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.25 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.45 
 
 
187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.35 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.93 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.55 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0507  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.62 
 
 
192 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  44.16 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.16 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.45 
 
 
179 aa  138  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.83 
 
 
192 aa  138  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1401  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.25 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.88 
 
 
190 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.33 
 
 
191 aa  136  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.4 
 
 
190 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.31 
 
 
192 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.63 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.7 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.39 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>