213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2493 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
185 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
185 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  89.67 
 
 
185 aa  333  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  81.32 
 
 
184 aa  296  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  80.56 
 
 
188 aa  291  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  80.45 
 
 
183 aa  289  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  80.45 
 
 
183 aa  289  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  80.45 
 
 
183 aa  289  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  79.33 
 
 
183 aa  288  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  79.33 
 
 
242 aa  286  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  77.78 
 
 
192 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  79.33 
 
 
191 aa  284  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  78.77 
 
 
183 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  77.9 
 
 
184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  78.77 
 
 
183 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  79.33 
 
 
183 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  77.65 
 
 
190 aa  275  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  77.65 
 
 
190 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  77.65 
 
 
191 aa  275  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  77.65 
 
 
191 aa  275  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  77.65 
 
 
187 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  77.65 
 
 
190 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  77.65 
 
 
191 aa  275  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.91 
 
 
189 aa  259  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  70 
 
 
190 aa  256  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  68.33 
 
 
197 aa  255  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  70 
 
 
189 aa  249  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  67.22 
 
 
190 aa  249  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  67.22 
 
 
202 aa  248  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  66.11 
 
 
190 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  69.44 
 
 
198 aa  241  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.09 
 
 
196 aa  236  9e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1498  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.29 
 
 
173 aa  231  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.576361  normal  0.890005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0942  ATP--cobalamin adenosyltransferase  67.93 
 
 
191 aa  231  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  65.41 
 
 
192 aa  230  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  64.8 
 
 
183 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  60.67 
 
 
191 aa  214  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3773  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  66.3 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0185512 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.56 
 
 
185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  59.68 
 
 
185 aa  211  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  58.99 
 
 
184 aa  207  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  58.99 
 
 
184 aa  206  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  58.15 
 
 
185 aa  204  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  55.98 
 
 
194 aa  203  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  57.3 
 
 
189 aa  203  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.22 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  58.43 
 
 
184 aa  194  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.97 
 
 
189 aa  191  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  51.4 
 
 
181 aa  177  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.41 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
194 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.65 
 
 
190 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  49.46 
 
 
192 aa  168  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  49.46 
 
 
192 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.41 
 
 
188 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.49 
 
 
188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.93 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  51.61 
 
 
192 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  44.83 
 
 
214 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  51.61 
 
 
192 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.38 
 
 
190 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.37 
 
 
189 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.89 
 
 
191 aa  157  8e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.83 
 
 
214 aa  156  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.74 
 
 
187 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.33 
 
 
203 aa  154  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.65 
 
 
186 aa  153  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.87 
 
 
198 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.53 
 
 
190 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.06 
 
 
195 aa  148  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
198 aa  147  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.28 
 
 
190 aa  147  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3660  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
191 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0197114  normal  0.165912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
192 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
192 aa  147  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1076  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.51 
 
 
191 aa  147  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.84 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.09 
 
 
192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
190 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.74 
 
 
190 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.18 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.45 
 
 
190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.91 
 
 
198 aa  144  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.87 
 
 
190 aa  144  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.54 
 
 
192 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.65 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.92 
 
 
190 aa  144  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.28 
 
 
192 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.42 
 
 
203 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.21 
 
 
191 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.22 
 
 
191 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  47.09 
 
 
190 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.32 
 
 
195 aa  141  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.4 
 
 
193 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1499  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.67 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000121183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>