213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0252 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
183 aa  358  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
183 aa  358  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
183 aa  358  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  95.08 
 
 
183 aa  347  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  95.08 
 
 
242 aa  347  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  96.17 
 
 
183 aa  345  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  96.17 
 
 
183 aa  344  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  85.64 
 
 
188 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  84.53 
 
 
184 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  83.43 
 
 
192 aa  306  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  82.87 
 
 
183 aa  298  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  82.87 
 
 
190 aa  295  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  82.87 
 
 
190 aa  295  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  82.87 
 
 
191 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  82.87 
 
 
191 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  82.87 
 
 
187 aa  295  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  82.87 
 
 
190 aa  295  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  82.87 
 
 
191 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  80.45 
 
 
185 aa  289  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  80.45 
 
 
185 aa  289  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  79.56 
 
 
185 aa  287  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  75.14 
 
 
191 aa  275  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  71.98 
 
 
184 aa  263  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.41 
 
 
189 aa  250  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  66.48 
 
 
190 aa  246  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  66.48 
 
 
197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  66.48 
 
 
202 aa  240  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  63.89 
 
 
196 aa  238  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  63.74 
 
 
190 aa  236  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  62.64 
 
 
190 aa  234  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  65.38 
 
 
189 aa  231  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  67.03 
 
 
198 aa  228  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0942  ATP--cobalamin adenosyltransferase  65.05 
 
 
191 aa  225  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  63.44 
 
 
192 aa  223  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1498  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.13 
 
 
173 aa  221  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.576361  normal  0.890005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  60.67 
 
 
191 aa  216  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  62.01 
 
 
183 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  58.47 
 
 
185 aa  209  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  56.83 
 
 
184 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  56.28 
 
 
187 aa  208  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  58.19 
 
 
189 aa  206  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  58.56 
 
 
184 aa  205  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3773  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  63.83 
 
 
192 aa  205  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0185512 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.3 
 
 
185 aa  203  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  60.11 
 
 
184 aa  202  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  55.25 
 
 
194 aa  201  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  59.24 
 
 
185 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.89 
 
 
189 aa  194  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  53.59 
 
 
181 aa  189  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  54.3 
 
 
192 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.49 
 
 
188 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  53.23 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  48.92 
 
 
192 aa  168  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  49.46 
 
 
192 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
194 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
191 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.49 
 
 
188 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.49 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  44.12 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.93 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.63 
 
 
214 aa  162  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.39 
 
 
203 aa  161  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
190 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
198 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
191 aa  155  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.94 
 
 
189 aa  154  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.32 
 
 
187 aa  154  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.32 
 
 
191 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
191 aa  151  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.21 
 
 
203 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.6 
 
 
190 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.32 
 
 
191 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.89 
 
 
190 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
186 aa  147  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.37 
 
 
198 aa  147  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.88 
 
 
185 aa  147  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.75 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.55 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.67 
 
 
190 aa  144  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.87 
 
 
190 aa  144  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3660  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
191 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0197114  normal  0.165912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.56 
 
 
198 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.28 
 
 
195 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1076  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.9 
 
 
191 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.21 
 
 
190 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.21 
 
 
196 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  43.02 
 
 
183 aa  141  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  45.83 
 
 
190 aa  141  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.68 
 
 
203 aa  141  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  47.62 
 
 
190 aa  140  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.44 
 
 
190 aa  140  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.54 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.44 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.95 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.39 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.44 
 
 
192 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  46.84 
 
 
190 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.16 
 
 
190 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.46 
 
 
178 aa  139  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>