213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0043 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  100 
 
 
190 aa  387  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0063  ATP/cobalamin adenosyltransferase  97.37 
 
 
190 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  86.84 
 
 
190 aa  337  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0098  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  83.15 
 
 
198 aa  295  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  80.77 
 
 
202 aa  292  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  75 
 
 
197 aa  285  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0113  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  75.54 
 
 
189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1478  cobalamin adenosyltransferase  74.47 
 
 
192 aa  263  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0485137  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  66.67 
 
 
188 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  66.67 
 
 
184 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  67.22 
 
 
185 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  67.22 
 
 
185 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0942  ATP--cobalamin adenosyltransferase  71.81 
 
 
191 aa  248  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  69.23 
 
 
184 aa  248  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  63.83 
 
 
192 aa  246  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  65.19 
 
 
185 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.29 
 
 
183 aa  238  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  66.3 
 
 
191 aa  238  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  64.29 
 
 
183 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  63.74 
 
 
183 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  63.74 
 
 
183 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  64.29 
 
 
183 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  63.74 
 
 
183 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3773  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  73.4 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0185512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.64 
 
 
242 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  61.38 
 
 
190 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  61.38 
 
 
190 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  61.38 
 
 
190 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  61.38 
 
 
191 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  61.38 
 
 
191 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  61.38 
 
 
191 aa  231  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  62.98 
 
 
183 aa  230  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  62.98 
 
 
187 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.62 
 
 
189 aa  226  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.3 
 
 
196 aa  202  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.84 
 
 
185 aa  201  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2647  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.14 
 
 
187 aa  201  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  55.06 
 
 
184 aa  198  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1498  ATP--cobalamin adenosyltransferase  58.93 
 
 
173 aa  197  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.576361  normal  0.890005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  55.62 
 
 
189 aa  197  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  57.38 
 
 
184 aa  192  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.51 
 
 
185 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  59.02 
 
 
183 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  56.04 
 
 
185 aa  188  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.56 
 
 
191 aa  185  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  53.04 
 
 
194 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0673  ATP/cobalamin adenosyltransferase  54.35 
 
 
184 aa  177  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201294  normal  0.906453 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.65 
 
 
189 aa  175  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  49.73 
 
 
192 aa  167  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1362  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.76 
 
 
214 aa  166  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.391231  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1002  cobalamin adenosyltransferase  44.76 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346886  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0935  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.06 
 
 
191 aa  160  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57180  hypothetical protein  49.2 
 
 
192 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4090  hypothetical protein  48.39 
 
 
192 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.59965  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4970  hypothetical protein  49.2 
 
 
192 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1264  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.07 
 
 
203 aa  158  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0381922  normal  0.144531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4500  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.07 
 
 
188 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579528  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4396  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.77 
 
 
192 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0867  cobalamin adenosyltransferase  48.07 
 
 
181 aa  155  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.420027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4424  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.24 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0956  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.35 
 
 
188 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4375  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.07 
 
 
188 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1349  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.07 
 
 
188 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.4 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.47 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1076  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.09 
 
 
191 aa  143  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3660  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0197114  normal  0.165912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.72 
 
 
189 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.2 
 
 
178 aa  137  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.51 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.74 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.51 
 
 
191 aa  135  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.32 
 
 
186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.09 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.89 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.6 
 
 
185 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.57 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  40.11 
 
 
183 aa  131  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.85 
 
 
198 aa  131  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  42.86 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.34 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.56 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02439  putative vitamin B12 related Cobalamin adenosyltransferase  43.86 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  44.57 
 
 
190 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.08 
 
 
191 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1221  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.68 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.39 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.55 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.76 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.76 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.09 
 
 
207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.92 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  38.1 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.08 
 
 
192 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.17 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.92 
 
 
190 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.92 
 
 
190 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.98 
 
 
196 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.62 
 
 
190 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.78 
 
 
203 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>