212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2404 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  100 
 
 
198 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  73.23 
 
 
198 aa  299  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  71.57 
 
 
196 aa  283  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  70.56 
 
 
196 aa  281  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  69.65 
 
 
203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  67.91 
 
 
198 aa  257  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  69.73 
 
 
190 aa  256  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  68.65 
 
 
191 aa  255  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1221  ATP/cobalamin adenosyltransferase  65.66 
 
 
199 aa  250  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.36 
 
 
190 aa  248  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.36 
 
 
190 aa  248  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  63.83 
 
 
190 aa  247  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  63.49 
 
 
191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.55 
 
 
191 aa  244  9e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  62.96 
 
 
190 aa  243  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  64.52 
 
 
207 aa  241  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  62.63 
 
 
203 aa  239  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  63.59 
 
 
190 aa  238  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  63.24 
 
 
190 aa  237  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11341  hypothetical protein  68.62 
 
 
193 aa  235  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000044047  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  63.35 
 
 
195 aa  231  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  60.94 
 
 
195 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  61.08 
 
 
190 aa  215  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18150  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  55.72 
 
 
216 aa  209  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.488735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  61.17 
 
 
190 aa  202  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.9 
 
 
190 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547441  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  52.58 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.58 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.97 
 
 
191 aa  180  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.12 
 
 
189 aa  180  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  54.97 
 
 
190 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.93 
 
 
191 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.36 
 
 
192 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.12 
 
 
192 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.88 
 
 
190 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.19 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.58 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  53.4 
 
 
190 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  54.45 
 
 
190 aa  171  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.31 
 
 
190 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.31 
 
 
196 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  53.12 
 
 
192 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.06 
 
 
190 aa  168  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.33 
 
 
190 aa  168  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  53.93 
 
 
190 aa  167  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.93 
 
 
190 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.32 
 
 
184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.97 
 
 
186 aa  165  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  52.6 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  51.31 
 
 
190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  50 
 
 
190 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
192 aa  160  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.88 
 
 
191 aa  160  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
192 aa  160  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.45 
 
 
195 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.31 
 
 
193 aa  158  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.96 
 
 
191 aa  158  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.31 
 
 
196 aa  157  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50 
 
 
192 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
192 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
196 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
183 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
183 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
183 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.08 
 
 
183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
192 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
183 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.75 
 
 
197 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.26 
 
 
242 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.15 
 
 
189 aa  153  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  52.15 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  51.3 
 
 
190 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  51.61 
 
 
190 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  51.61 
 
 
190 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
191 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
191 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  51.61 
 
 
187 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  51.61 
 
 
190 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51.61 
 
 
191 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
184 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.44 
 
 
191 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  46.77 
 
 
184 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.46 
 
 
188 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0623  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.57 
 
 
191 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253905  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.46 
 
 
185 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3086  cobalamin adenosyltransferase  54.82 
 
 
193 aa  148  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
185 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
185 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.83 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.9 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0858  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.76 
 
 
178 aa  144  9e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.59 
 
 
185 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.37 
 
 
187 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.06 
 
 
185 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.2 
 
 
190 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.28 
 
 
188 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
190 aa  141  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.03 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>