212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0343 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0343  ATP/cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
198 aa  397  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.430569  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2404  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  73.23 
 
 
198 aa  299  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1675  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  68.18 
 
 
196 aa  269  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.522537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0903  ATP/cobalamin adenosyltransferase  68.69 
 
 
196 aa  266  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254406  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3911  ATP/cobalamin adenosyltransferase  64.68 
 
 
203 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.807337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1258  ATP/cobalamin adenosyltransferase  67.02 
 
 
198 aa  254  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.213795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3704  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  65.43 
 
 
190 aa  245  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1770  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  64.55 
 
 
191 aa  244  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.672837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1221  ATP/cobalamin adenosyltransferase  64.65 
 
 
199 aa  240  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1026  ATP--cobalamin adenosyltransferase  63.64 
 
 
190 aa  238  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4132  ATP/cobalamin adenosyltransferase  62.77 
 
 
207 aa  237  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  62.23 
 
 
191 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.518932  normal  0.0827068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2321  ATP--cobalamin adenosyltransferase  60.64 
 
 
191 aa  235  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.125713  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29520  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  61.05 
 
 
190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.52712  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3859  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.26 
 
 
190 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00573186  hitchhiker  0.00504953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3873  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.26 
 
 
190 aa  230  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0175565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3947  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  59.26 
 
 
190 aa  230  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000679648  decreased coverage  0.00351381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11341  hypothetical protein  65.61 
 
 
193 aa  224  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000044047  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6133  ATP/cobalamin adenosyltransferase  60.22 
 
 
190 aa  222  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.901207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1924  ATP/cobalamin adenosyltransferase  55.78 
 
 
203 aa  215  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0656  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  57.07 
 
 
195 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2130  ATP/cobalamin adenosyltransferase  59.16 
 
 
195 aa  211  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  decreased coverage  0.00205688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18150  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  54.73 
 
 
216 aa  204  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.488735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1841  ATP/cobalamin adenosyltransferase  56.99 
 
 
190 aa  204  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.61 
 
 
190 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  56.08 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547441  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.61 
 
 
189 aa  181  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  52.36 
 
 
190 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2358  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  53.4 
 
 
191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.31 
 
 
190 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  50.52 
 
 
195 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
195 aa  171  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.52 
 
 
191 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.51 
 
 
190 aa  165  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.02 
 
 
190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2530  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.21 
 
 
192 aa  165  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.754609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.15 
 
 
184 aa  165  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.97 
 
 
195 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0459  ATP/cobalamin adenosyltransferase  52.08 
 
 
191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1541  ATP--cobalamin adenosyltransferase  50.25 
 
 
197 aa  164  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.780585  normal  0.0563576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  49.21 
 
 
190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1821  ATP/cobalamin adenosyltransferase  50.79 
 
 
190 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.340765 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.96 
 
 
192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.69 
 
 
190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0149  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.72 
 
 
196 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2428  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.48 
 
 
190 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.44 
 
 
192 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.44 
 
 
192 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4008  hypothetical protein  49.48 
 
 
192 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.21 
 
 
190 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0553  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  52.55 
 
 
186 aa  158  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2161  ATP--cobalamin adenosyltransferase  51.3 
 
 
193 aa  157  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.283736 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  47.37 
 
 
184 aa  157  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.17 
 
 
192 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3482  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
190 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.710517  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  47.92 
 
 
192 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  46.84 
 
 
190 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.12 
 
 
192 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1007  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
196 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1925  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.68 
 
 
189 aa  153  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  47.64 
 
 
190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2786  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50 
 
 
191 aa  151  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705482  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  48.47 
 
 
196 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2923  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  50.54 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.445549  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.83 
 
 
190 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2899  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.91 
 
 
185 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.91 
 
 
185 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.31 
 
 
191 aa  144  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  47.83 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.03 
 
 
192 aa  144  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.56 
 
 
183 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  46.56 
 
 
183 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.56 
 
 
183 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.99 
 
 
185 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.45 
 
 
185 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0652  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.56 
 
 
183 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.56 
 
 
242 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0626  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.56 
 
 
183 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  45.41 
 
 
185 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.03 
 
 
183 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1568  ATP/cobalamin adenosyltransferase  48.91 
 
 
183 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2549  ATP--cobalamin adenosyltransferase  49.74 
 
 
190 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.2 
 
 
197 aa  141  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2656  ATP protein  45.16 
 
 
184 aa  141  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.23 
 
 
185 aa  141  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  46.2 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.99 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3086  cobalamin adenosyltransferase  52.28 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.99 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.26 
 
 
196 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  44.74 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  44.92 
 
 
185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04640  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  45.65 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.204652  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0546  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.59 
 
 
185 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0341979  hitchhiker  0.00608443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  45.11 
 
 
188 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.77 
 
 
187 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.77 
 
 
190 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  46.77 
 
 
190 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.77 
 
 
191 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>