213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1737 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1737  ATP--cobalamin adenosyltransferase  100 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  44.22 
 
 
335 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  44.86 
 
 
336 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  44.32 
 
 
336 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  44.86 
 
 
336 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  44.86 
 
 
336 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  44.86 
 
 
336 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1980  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.98 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0245257  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2831  cobalamin adenosyltransferase  44.38 
 
 
184 aa  144  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3787  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.77 
 
 
191 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00141752  normal  0.246617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0224  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.37 
 
 
179 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3587  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.17 
 
 
187 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736808 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0130  ATP--cobalamin adenosyltransferase  46.39 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3302  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.44 
 
 
186 aa  138  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0880  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.94 
 
 
176 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1814  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  42.68 
 
 
194 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3476  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40 
 
 
185 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09091  hypothetical protein  41.81 
 
 
190 aa  136  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02439  putative vitamin B12 related Cobalamin adenosyltransferase  42.26 
 
 
171 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2959  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.62 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3560  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.41 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3628  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.41 
 
 
185 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5002  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.77 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3694  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.22 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.4 
 
 
333 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1178  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.37 
 
 
170 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.341742  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2555  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.01 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0549  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.46 
 
 
190 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1009  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  42.77 
 
 
170 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000622248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0957  ATP--cobalamin adenosyltransferase  41.21 
 
 
185 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1592  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.59 
 
 
185 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4881  ATP  40.12 
 
 
190 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3813  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.2 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0245524 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1692  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.45 
 
 
192 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2576  ATP/cobalamin adenosyltransferase  42.94 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.98214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2512  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.56 
 
 
192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0325  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.89 
 
 
192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0465859  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0218  putative ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.92 
 
 
190 aa  128  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1702  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.46 
 
 
190 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1778  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.29 
 
 
173 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1124  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  40.59 
 
 
183 aa  127  8.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6889  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.96 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.318925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0066  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.55 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0722  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.76 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.373933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1533  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.94 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000827294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1139  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.35 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3976  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.16 
 
 
188 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1099  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.6 
 
 
192 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0372128  normal  0.321673 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3905  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.39 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1388  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.35 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00323474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1499  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  42.35 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000121183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2203  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.2 
 
 
191 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5233  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.92 
 
 
190 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1401  ATP--cobalamin adenosyltransferase  42.94 
 
 
193 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3812  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  41.18 
 
 
193 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000130321  hitchhiker  3.4004899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1118  ATP/cobalamin adenosyltransferase  43.2 
 
 
187 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00598817  normal  0.855545 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0791  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.76 
 
 
184 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3294  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.55 
 
 
187 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1639  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.27 
 
 
193 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000121298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2416  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.55 
 
 
190 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3318  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.36 
 
 
196 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250014 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3339  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.55 
 
 
190 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1293  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  39.16 
 
 
183 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3559  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.67 
 
 
192 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.35392 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0333  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.55 
 
 
191 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1194  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.55 
 
 
191 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3328  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  38.55 
 
 
190 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2604  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.55 
 
 
191 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1975  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  40.66 
 
 
195 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1360  hypothetical protein  43.27 
 
 
193 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000443802  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0752  cobalamin adenosyltransferase  41.07 
 
 
190 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1900  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.66 
 
 
195 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1603  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase, putative  43.27 
 
 
193 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2008  ATP--cobalamin adenosyltransferase  39.89 
 
 
191 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.908345  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1571  putative ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  43.27 
 
 
193 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1084899999999994e-45 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3804  ATP/cobalamin adenosyltransferase  39.05 
 
 
184 aa  121  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1361  hypothetical protein  42.69 
 
 
193 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000348693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0818  cobalamin adenosyltransferase  37.08 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0929  ATP  37.72 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3031  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.89 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.758339  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1780  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.46 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3108  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.79 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2650  ATP--cobalamin adenosyltransferase  38.55 
 
 
242 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0727054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3852  ATP/cobalamin adenosyltransferase  40.56 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0054  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.55 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0704  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.35 
 
 
183 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0252  cobalamin adenosyltransferase  37.35 
 
 
183 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0736  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.35 
 
 
183 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1609  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.45 
 
 
196 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3822  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.35 
 
 
183 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78304  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0070  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.95 
 
 
197 aa  118  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1049  ATP--cobalamin adenosyltransferase  40.78 
 
 
192 aa  117  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.454807  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0043  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.35 
 
 
190 aa  117  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567023  normal  0.453567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0425  ATP/cobalamin adenosyltransferase  41.18 
 
 
192 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0509  ATP/cobalamin adenosyltransferase  37.43 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2663  hypothetical protein  34.92 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0666  cobalamin adenosyltransferase  35.67 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.264853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0419  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  39.52 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553161  hitchhiker  0.00794849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13380  Cobalamin adenosyltransferase  37.79 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2493  ATP/cobalamin adenosyltransferase  38.55 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>